HDU 3341 Lost's revenge(AC自动机+DP+变进制优化)

本文介绍了一种针对DNA序列重新排列的问题,通过优化算法确保排列中包含尽可能多的数论基因。利用压缩状态的方法减少内存消耗,并采用动态规划实现高效求解。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

题目是给一个DNA重新排列使其包含最多的数论基因。

字符最长是40
只需要记录ACGT出现的次数。
如果使用5维数组,显然超内存了。
假设ACGT的总数分别为num[0],num[1],num[2],num[3]
那么对于ACGT的数量分别为ABCD的状态可以记录为:
A*(num[1]+1)*(num[2]+1)*(num[3]+1) + B*(num[2]+1)*(num[3]+1)+ C*(num[3]+1) +D
这样的状态最大就是11*11*11*11
复杂度也可以承受了。
字符串可能有重复的,用int来记录数量

忘了dp【j】【i】小于0直接continue的情况,wa了好多。。
#include <set>
#include <map>
#include <stack>
#include <queue>
#include <deque>
#include <cmath>
#include <vector>
#include <string>
#include <cstdio>
#include <cstdlib>
#include <cstring>
#include <iostream>
#include <algorithm>
using namespace std;
#define L(i) i<<1
#define R(i) i<<1|1
#define INF  0x3f3f3f3f
#define pi acos(-1.0)
#define eps 1e-9
#define maxn 60010
#define MOD 1000000007

int n,m;
int dp[510][20010];
int bit[13],num[13];
struct Trie
{
    int next[510][5],fail[510],en[510];
    int root,L;
    void init()
    {
        L = 0;
        root = newnode();
    }
    int newnode()
    {
        for(int i = 0; i < 4; i++)
            next[L][i] = -1;
        en[L++] = 0;
        return L-1;
    }
    int getch(char ch)
    {
        if(ch == 'A')
            return 0;
        else if(ch == 'C')
            return 1;
        else if(ch == 'G')
            return 2;
        return 3;
    }
    void Insert(char buf[])
    {
        int now = root;
        int len = strlen(buf);
        for(int i = 0; i < len; i++)
        {
            if(next[now][getch(buf[i])] == -1)
                next[now][getch(buf[i])] = newnode();
            now = next[now][getch(buf[i])];
        }
        en[now]++;
    }
    void build()
    {
        queue<int> Q;
        fail[root] = root;
        for(int i = 0; i < 4; i++)
        {
            if(next[root][i] == -1)
                next[root][i] = root;
            else
            {
                fail[next[root][i]] = root;
                Q.push(next[root][i]);
            }
        }
        while(!Q.empty())
        {
            int now = Q.front();
            Q.pop();
            en[now] += en[fail[now]];
            for(int i = 0; i < 4; i++)
            {
                if(next[now][i] == -1)
                    next[now][i] = next[fail[now]][i];
                else
                {
                    fail[next[now][i]] = next[fail[now]][i];
                    Q.push(next[now][i]);
                }
            }
        }
    }
    int ok(int x,int &a,int &b,int &c,int &d)
    {
        a = x/bit[0];
        if(a > num[0])
            return 0;
        x -= a*bit[0];
        b = x/bit[1];
        if(b > num[1])
            return 0;
        x -= b*bit[1];
        c = x/bit[2];
        if(c > num[2])
            return 0;
        x -= c*bit[2];
        d = x/bit[3];
        if(d > num[3] || x-d*bit[3] != 0)
            return 0;

        return 1;
    }
    int solve()
    {
        char s[1010];
        scanf("%s",s);
        int len = strlen(s);
        memset(num,0,sizeof(num));
        for(int i = 0; i < len; i++)
            num[getch(s[i])]++;
        bit[0] = (num[1]+1)*(num[2]+1)*(num[3]+1);
        bit[1] = (num[2]+1)*(num[3]+1);
        bit[2] = num[3]+1;
        bit[3] = 1;
        int ss = num[0]*bit[0] + num[1]*bit[1] + num[2]*bit[2] + num[3]*bit[3];
        memset(dp,-1,sizeof(dp));
        dp[root][0] = 0;
        for(int i = 0; i <= ss; i++)
        {
            int a,b,c,d;
            if(ok(i,a,b,c,d))
                for(int j = 0; j < L; j++)
                {
                    if(dp[j][i] < 0)
                        continue;
                    if(a < num[0])
                        dp[next[j][0]][i+bit[0]] = max(dp[next[j][0]][i+bit[0]],dp[j][i]+en[next[j][0]]);
                    if(b < num[1])
                        dp[next[j][1]][i+bit[1]] = max(dp[next[j][1]][i+bit[1]],dp[j][i]+en[next[j][1]]);
                    if(c < num[2])
                        dp[next[j][2]][i+bit[2]] = max(dp[next[j][2]][i+bit[2]],dp[j][i]+en[next[j][2]]);
                    if(d < num[3])
                        dp[next[j][3]][i+bit[3]] = max(dp[next[j][3]][i+bit[3]],dp[j][i]+en[next[j][3]]);
                }
        }
        int ans = 0;
        for(int i = 0; i < L; i++)
            ans = max(ans,dp[i][ss]);
        return ans;
    }
} ac;
int main()
{
    int t,C = 1;
    //scanf("%d",&t);
    while(scanf("%d",&n) && n)
    {
        ac.init();
        char s[1010];
        for(int i = 0; i < n; i++)
        {
            scanf("%s",s);
            ac.Insert(s);
        }
        ac.build();
        printf("Case %d: %d\n",C++,ac.solve());
    }
    return 0;
}

大牛代码:
#include <set>
#include <map>
#include <stack>
#include <queue>
#include <deque>
#include <cmath>
#include <vector>
#include <string>
#include <cstdio>
#include <cstdlib>
#include <cstring>
#include <iostream>
#include <algorithm>
using namespace std;
#define L(i) i<<1
#define R(i) i<<1|1
#define INF  0x3f3f3f3f
#define pi acos(-1.0)
#define eps 1e-9
#define maxn 60010
#define MOD 1000000007

int n,m;
int dp[510][20010];
int bit[13],num[13];
struct Trie
{
    int next[510][5],fail[510],en[510];
    int root,L;
    void init()
    {
        L = 0;
        root = newnode();
    }
    int newnode()
    {
        for(int i = 0; i < 4; i++)
            next[L][i] = -1;
        en[L++] = 0;
        return L-1;
    }
    int getch(char ch)
    {
        if(ch == 'A')
            return 0;
        else if(ch == 'C')
            return 1;
        else if(ch == 'G')
            return 2;
        return 3;
    }
    void Insert(char buf[])
    {
        int now = root;
        int len = strlen(buf);
        for(int i = 0; i < len; i++)
        {
            if(next[now][getch(buf[i])] == -1)
                next[now][getch(buf[i])] = newnode();
            now = next[now][getch(buf[i])];
        }
        en[now]++;
    }
    void build()
    {
        queue<int> Q;
        fail[root] = root;
        for(int i = 0; i < 4; i++)
        {
            if(next[root][i] == -1)
                next[root][i] = root;
            else
            {
                fail[next[root][i]] = root;
                Q.push(next[root][i]);
            }
        }
        while(!Q.empty())
        {
            int now = Q.front();
            Q.pop();
            en[now] += en[fail[now]];
            for(int i = 0; i < 4; i++)
            {
                if(next[now][i] == -1)
                    next[now][i] = next[fail[now]][i];
                else
                {
                    fail[next[now][i]] = next[fail[now]][i];
                    Q.push(next[now][i]);
                }
            }
        }
    }
    int solve()
    {
        char s[1010];
        scanf("%s",s);
        int len = strlen(s);
        memset(num,0,sizeof(num));
        for(int i = 0; i < len; i++)
            num[getch(s[i])]++;
        bit[0] = (num[1]+1)*(num[2]+1)*(num[3]+1);
        bit[1] = (num[2]+1)*(num[3]+1);
        bit[2] = num[3]+1;
        bit[3] = 1;
        memset(dp,-1,sizeof(dp));
        dp[root][0] = 0;
        for(int A = 0; A <= num[0]; A++)
            for(int B = 0; B <= num[1]; B++)
                for(int C = 0; C <= num[2]; C++)
                    for(int D = 0; D <= num[3]; D++)
                    {
                        int s = A*bit[0] + B*bit[1] + C*bit[2] + D*bit[3];
                        for(int i = 0; i < L; i++)
                            if(dp[i][s] >= 0)
                            {
                                for(int k = 0; k < 4; k++)
                                {
                                    if(k == 0 && A == num[0])
                                        continue;
                                    if(k == 1 && B == num[1])
                                        continue;
                                    if(k == 2 && C == num[2])
                                        continue;
                                    if(k == 3 && D == num[3])
                                        continue;
                                    dp[next[i][k]][s+bit[k]] = max(dp[next[i][k]][s+bit[k]],dp[i][s]+en[next[i][k]]);
                                }
                            }
                    }
        int ans = 0;
        int ss = num[0]*bit[0] + num[1]*bit[1] + num[2]*bit[2] + num[3]*bit[3];
        for(int i = 0; i < L; i++)
            ans = max(ans,dp[i][ss]);
        return ans;
    }
} ac;
int main()
{
    int t,C = 1;
    //scanf("%d",&t);
    while(scanf("%d",&n) && n)
    {
        ac.init();
        char s[1010];
        for(int i = 0; i < n; i++)
        {
            scanf("%s",s);
            ac.Insert(s);
        }
        ac.build();
        printf("Case %d: %d\n",C++,ac.solve());
    }
    return 0;
}


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