介观模拟方法:从理论到实践
1. 耗散粒子动力学(DPD)
耗散粒子动力学(DPD)是一种介观模拟方法,其相关代码文件可在线获取。 dpd.f90 程序结合 dpd_module.f90 中的小模块以及附录中的实用模块,使用 Shardlow(2003)的算符分裂算法,或替代的成对 Lowe - Andersen 恒温器(Lowe,1999),实现通过软 DPD 势相互作用的珠子的动力学模拟。
1.1 代码示例
! dpd.f90
! Dissipative particle dynamics
PROGRAM dpd
! dpd_module.f90
! Dissipative particle dynamics module
MODULE dpd_module
1.2 恒温器
Allen 和 Schmid(2007)的 Hoover 恒温器结合作用于动态摩擦系数的附加朗之万方程,但仅用此方法无法在宽范围内调节粘度,可能需要与 Lowe - Andersen 方法结合。
2. 多粒子碰撞动力学(MPCD)
多粒子碰撞动力学(MPCD)最初被称为随机旋转方法,由 Malevanets 和 Kapral(1999)提出。该方法旨在显式(尽管是近似地)模拟溶剂,同时避免对溶剂粒子进行微观真实表示的高成本。
2.1 溶剂模型
溶剂粒子通过离散碰撞重新分配动量,碰撞间隔为 $\delta t$,在无溶质时,溶剂粒子
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