E_gene的博客

具体而言，MPs暴露导致乳酸化标记（H3K18la、Pan-Kla）上调约50%，ROS水平升高1.4倍，通过"乳酸化激活duox→ROS生成→ROS促进乳酸化"的自我放大环路，持续驱动中性粒细胞炎症。这些结果表明，微塑料通过诱导氧化应激，扰乱了中性粒细胞的正常迁移功能。此研究利用活体斑马鱼模型，结合成像技术和ChIP-seq技术，首次实现了对微塑料暴露下中性粒细胞迁移全过程的可视化追踪，并揭示了其背后的ROS-H3K18乳酸化正反馈调控环路，这一发现为理解微塑料的免疫毒性机制提供了重要的理论依据。

拟南芥根不同类型细胞的甲基组比较显示，大多数根细胞类型的甲基组大体相似，但根冠细胞的甲基组与其他根细胞类型显著不同，表现出全基因组范围的mCHH甲基化(主要在转座子中)，表明该细胞类型中RNA指导的DNA甲基化(RdDM)上调。例如，拟南芥在感染真菌病原体Fusarium oxysporum时，需要通过DNA去甲基化来进行正常防御，表明要么DNA去甲基化需要用于活性防御基因表达程序，要么主动去甲基化需要维持甲基组状态以实现正常功能，因此DNA甲基化的动态变化对于植物的免疫反应至关重要。

本文深入剖析了DNA甲基化在哺乳动物发育与疾病中的多重角色，为表观遗传学领域提供了前沿且全面的视角。不仅阐释了DNA甲基化在基因调控、转座元件沉默及基因组稳定性中的关键作用，还揭示了其在胚胎发育、生殖细胞系分化等过程中的时序性变化与复杂机制力。此外，对表观遗传基因突变与复杂疾病关系（包括理解衰老的发生机制）的解读，为临床诊断与治疗提供了理论基础。

中科院与瑞金医院团队利用WGBS技术绘制11种常见实体瘤DNA甲基化单体图谱，鉴定出81,567个癌症特异性甲基化单体区块（MHBs）。研究发现MHBs富集于基因调控区，与致癌通路相关且能独立预测基因表达。通过单细胞验证和多组学整合，证实MHBs可作为新型癌症标志物，在液体活检中展现出优于传统方法的检测性能（AUC达0.79-0.97）。该研究为理解肿瘤表观遗传调控提供了新视角，相关成果发表于《Cell Reports》（IF=6.9）。易基因作为表观组学服务商，提供WGBS等技术支持此类前沿研究。

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此外，研究还纳入了50个SMRT测序样本基因组的甲基化检测结果和oxBS测序的结果，与ONT测序进行横向比较研究阐明了每种测序方法的优势和局限性，并为使用长读长测序进行基因组规模的碱基修饰检测工具的标准化和评估提出了建议。研究将CpG位点分为未甲基化（0–0.15）、低甲基化（0.15–0.5）、中等甲基化（0.5–0.85）和高甲基化（0.85–1）四个类别，通过比较ONT测序和oxBS的结果显示，Nanopore测序在未甲基化和高甲基化CpG单元上的预测准确性最高，分别为86%和77%。

激动人心的时刻终于来了，2024年影响因子已全面发布！废话不多说，大家一起来看看最新的发布的结果吧！NEJM、The Lancet、JAMA、BMJ，这四本综合性医学杂志，是我们统称的。大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。毫无疑问，最高分必然是它，今年公布最新影响因子为503.1。，也是公认的历史最为悠久、顶级的综合性临床期刊。但几年看下来，四大刊已经有不小的变化……2024年度影响因子排名。”微信公众号后台回复：“

此外，结果表明METTL3通过m6A修饰增强Hspa1a mRNA的稳定性来调控成骨细胞衰老。易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段（包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA），结合高通量测序，可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量，总RNA起始量可降低至10μg，最低仅需1μg总RNA。差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修饰基因的PPI分析、候选基因的m6A修饰可视化展示。

易基因建立的靶基因甲基化高通量测序（Target Bisulfite sequencing，Target-BS）是针对已有目标基因panel组合，运用易基因自主研发的甲基化特异性多重PCR引物设计软件，对亚硫酸盐转化后的目标基因多重扩增，建库后进行超高深度（1000X以上）甲基化精准检测。易基因提供全面的表观基因组学（DNA甲基化、DNA羟甲基化）和表观转录组学（m6A、m5C、m1A、m7G）、染色质结构与功能组学技术方案（ChIP-seq、ATAC-seq），详询易基因：0755-28317900.

运用组蛋白特定修饰的特异性抗体或DNA结合蛋白或转录因子特异性抗体富集与其结合的DNA片段，并进行纯化和文库构建，然后进行高通量测序，通过将获得的数据与参考基因组精确比对，研究人员可获得全基因组范围内某种修饰类型的特定组蛋白或转录因子与基因组DNA序列之间的关系，也可对多个样品进行差异比较。X光照射的小鼠和年龄匹配的未受照射的对照小鼠在笼中保持3h。与X-射线的结果一样，多柔比星处理后，在肝脏和脾脏的Cdkn1a、Bbc3和Mdm2基因的反应元件上检测到p53的占据，Alb基因的一个区域被用作阴性对照。

中国细胞生物学学会衰老细胞生物学分会中国遗传学会衰老遗传学分会中国生物物理学会衰老生物学分会中国生理学会衰老与健康专业委员会中国老年医学学会基础与转化医学分会中国老年学和老年医学学会老年病学分会中国老年学和老年医学学会抗衰老分会中国衰老标志物研究联合体。本次大会以“解码衰老”为主题，旨在汇聚全球科研精英，共同探讨衰老科学的前沿话题，深入分析器官衰老的分子细胞机制，以及衰老相关疾病的预防与治疗策略。由中国细胞生物学学会衰老细胞生物学分会等单位联合主办，瓯江实验室、温州医科大学老年研究院等共同承办的。

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。检测器官和组织损伤对于早期诊断、治疗决策和监测疾病进展至关重要。由于DNA甲基化模式可以响应组织损伤而改变，甲基化检测提供了一种有前途的方法，在早筛早诊、疾病进展监测、治疗效果和器官移植评估等可行性方面具有潜在应用。组织或器官损伤后释放到血流中的cfDNA（cell-free DNA）可以作为损伤的生物标志物。cfDNA的表观遗传状态（包括DNA甲基化模式）可以提供对组织和器官损伤程度的见解。本文强调DNA甲基化作为一种广泛研究的表观遗传修饰，在

会议将为表观遗传学和染色质生物学相关研究领域的知名学者与青年科技人员提供相互交流的平台，共享当前相关领域的前沿热点与最新进展，以促进同行间的相互交流与合作。由中国遗传学会表观遗传学分会和中国细胞生物学学会染色质生物学分会联合主办，武汉大学承办的“2023表观遗传与染色质生物学大会”将于2023年8月14日-18日在湖北武汉召开。易基因科技将携RNA修饰研究、DNA甲基化和羟甲基化研究、染色质结构构象与DNA互作研究、单细胞组学研究等表观特色产品亮相本次大会。6.染色质与表观遗传学新技术。

完整名单请关注“易基因”微信公众号后台回复：“2023影响因子”，即可获得。

4)利用步骤(3)中筛选出的所述方法在研究中多个时期的组别分别进行统计，筛选出多个时期中只有单独一个时期特有的ASM区域为待选时期特异性ASM区间U(ASM i )，并筛选出所有位点的CpG位点的甲基化信息；分别统计区间内每条reads的对应位置的CpG位点的甲基化状态，定义读长中测序为C的位点为甲基化C(m)，测序为T的位点为非甲基化C(n)，并进一步统计测序读长的甲基化水平，methy_reads(i)＝C(m)/(C(m)+C(n))，i∈A U B；...

北京时间2022年6月28日，Clarivate Analytics官方发布最新年度（2021年）期刊引用报告（JCR），全球期刊影响因子（Impact factor，缩写IF）出炉。世界公认的三大名刊NCS世界公认的三大名刊主要是指：Nature，Cell，Science。整体来说今年三大刊的表现非常亮眼，影响因子分数均有较大提升，其中cell上升分数最多。其中Nature最新IF 69.504，比去年的49.962上升近20分；Cell最新IF 66.85，比去年的41.582上升约25分，Scienc

本期我们来聊聊一直以来备受关注的DNA甲基化。关键词：DNA甲基化

北京时间2021年6月30日，Clarivate Analytics官方发布最新年度（2020年）期刊引用报告（JCR），全球top400期刊影响因子（Impact factor，缩写IF）出炉。整体而言最新的SCI影响因子均有较大上升，神刊 CA-A Cancer Journal For Clinicians（临床肿瘤杂志）甚至首次突破500大关，高达508.7，连续十三年强势霸占榜首。国内期刊TOP10同样，国内的期刊影响因子呈现水涨船高的趋势，实力不容小觑。国内排名第一的期刊仍旧属于Cell R

近年来，癌症对于人类的健康威胁越来越大。根据最新的全球癌症数据显示：2018年全球癌症新发病例将达到1810万人次，而癌症死亡人数将达到960万人，也就是说，每秒就有209人确认为癌症，同时每秒有111人因为癌症离世。对于癌症来说，不论治疗技术如何先进，永远是预防比治疗的获益来得更多。通过早发现早治疗的策略，美国成功将乳腺癌的5年生存率提高到了全球最高的水平——高达98%，早期筛查出来的癌症患者基本上都是可以长期生存的；但与之相对的是晚期乳腺癌患者的5年生存期，仅不到40%，死亡风险大大增加。早诊断、早治