LiP-MS：开启癌症生物标志物发现的新篇章

更多详情请见：LiP-MS药物靶点筛选技术

在癌症研究领域，发现具有临床意义的生物标志物对于早期诊断、预后评估和个性化治疗至关重要。传统的蛋白质组学方法主要关注蛋白质的丰度变化，但忽略了蛋白质构象变化这一关键因素。近年来，有限蛋白水解-质谱联用技术（Limited Proteolysis coupled with Mass Spectrometry, LiP-MS）作为一种创新的蛋白质组学工具，为揭示蛋白质构象变化及其在癌症中的作用提供了新的视角。本文将重点介绍LiP-MS技术在癌症生物标志物发现中的应用，特别是其在口腔鳞状细胞癌（OSCC）研究中的突破性进展。

研究技术路线图

该研究利用LiP-MS技术对OSCC患者的唾液样本进行了深入分析，旨在发现与OSCC侵袭性相关的生物标志物，并利用LiP-MS技术发现了以下结果：

1.发现构象型蛋白质：研究发现，与健康对照组相比，OSCC患者的唾液中存在253种具有显著结构变化的蛋白质，而传统的基于胰蛋白酶消化的蛋白质组学方法仅能识别23种差异蛋白质。这些构象变化的蛋白质（称为构象型蛋白质）与多个临床病理特征相关，包括饮酒、吸烟、淋巴结转移和肿瘤大小。

2.揭示关键生物标志物：转酮酶（TKT）及其相互作用蛋白被认为与OSCC的侵袭性密切相关。研究发现，TKT在淋巴结转移（pN+）患者中表现出上调，并且其结构变化可能通过AKT介导的磷酸化事件发生。此外，研究还发现N-糖基化修饰对蛋白质结构的重排具有重要影响，例如免疫球蛋白重链α1（IGHA1）的糖基化修饰在OSCC患者的唾液中表现出显著变化。

3.预后和诊断潜力：LiP-MS技术不仅能够发现与OSCC相关的生物标志物，还能为疾病的预后和诊断提供新的视角。通过分析构象型蛋白质的变化，研究人员能够更准确地评估患者的疾病状态和预后情况。例如，TKT的上调和IGHA1的糖基化修饰变化可以作为潜在的诊断和预后标志物，帮助临床医生制定更精准的治疗方案。

LiP-MS技术的优势在于其能够揭示蛋白质构象变化及其相关的生物学过程，从而为癌症的诊断和预后提供新的生物标志物。与传统的基于蛋白质丰度的方法相比，LiP-MS能够检测到更丰富的生物学信息，尤其是在蛋白质动态范围较大的复杂生物基质中。此外，该技术还能够揭示蛋白质翻译后修饰（PTMs）对构象变化的影响，从而为理解疾病机制提供新的线索。

总之，LiP-MS技术在癌症生物标志物的发现中展现了巨大的潜力。通过结合LiP-MS与传统蛋白质组学方法，研究人员能够更全面地理解癌症的分子机制，并识别出具有临床应用价值的新型生物标志物。这一技术的进一步发展和应用有望为癌症的早期诊断和个性化治疗提供重要的支持。