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RSS订阅原创 热蛋白质组分析（TPP）：解锁蛋白质相互作用的全新视角
是一种创新的生物物理技术，它基于蛋白质在加热时的热稳定性变化，揭示蛋白质相互作用的动态网络。TPP的独特之处在于，它不仅能够检测稳定的蛋白质复合物，还能捕捉传统方法难以发现的瞬时和弱相互作用。例如，在研究热休克蛋白（HSP90）的客户蛋白网络时，TPP成功揭示了这些瞬时相互作用的动态特性，为理解蛋白质折叠和细胞应激反应提供了全新视角。例如，在病毒-宿主相互作用研究中，TPP技术帮助研究人员深入理解病毒如何通过改变宿主蛋白质的热稳定性来调控感染过程，为抗病毒药物的开发提供了新的靶点。则是细胞功能调控的基石。
2025-04-09 13:48:35
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原创 TPP实验：药物靶点筛选的精准导航
结合高分辨率质谱（MS）技术，TPP实现了全蛋白质组水平的定量分析，为药物靶点的精准筛选提供了强大的技术支持。例如，在抗炎药物机制研究中，TPP技术能够揭示药物与炎症相关蛋白的直接相互作用，从而为新型抗炎药物的开发提供关键靶点信息。随着技术的持续优化，TPP有望成为药物靶点发现和药物开发的标准化工具，为复杂疾病的治疗提供创新性解决方案。总体而言，组织TPP通过整合动物整体水平的蛋白质组状态和相互作用，为理解药物治疗和生物现象的影响提供了全局视角，为表型组织研究开辟了新的路径。
2025-04-08 14:14:50
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原创 深度解析宿主-病毒互作奥秘 | STRING Viruses数据库如何助力感染性疾病研究？
用于收集冠状病毒与宿主的物理相互作用基因，这些基因数据与遗传风险基因及生物调节基因一起，被整合到一个方向性病毒-宿主互作网络中。本文研究了结直肠癌（CRC）中病毒与宿主的相互作用，通过分析病毒宿主网络和CRC蛋白质组数据，揭示了核心病毒网络特征，并筛选出潜在的抗病毒小分子。研究意义：这篇文章通过整合多源数据构建方向性网络，创新性地筛选出具有潜在治疗效果的药物，为冠状病毒相关疾病的药物重新定位提供了新策略，有助于加速COVID-19治疗药物的开发并减少药物副作用。
2025-04-08 10:42:01
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原创 TPP与蛋白质翻译后修饰：开启蛋白质研究的新维度
TPP（Thermal Proteome Profiling）实验又名热蛋白组学分析，是一种基于热稳定性的蛋白质组学分析技术，通过测量蛋白质在不同温度下的热稳定性变化，揭示蛋白质与小分子药物、代谢物或其他分子的相互作用。TPP实验与蛋白质翻译后修饰的结合为研究蛋白质的动态行为和功能调控提供了强大的工具。通过揭示PTM对蛋白质热稳定性的影响，TPP实验能够深入解析蛋白质的功能调控机制，并在药物研发、疾病机制解析和蛋白质功能研究中展现出广阔的应用前景。为研究蛋白质的动态行为和功能调控提供了独特的视角。
2025-04-07 14:28:33
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原创 TPP实验技术的实验原理与流程
TPP技术基于小分子与蛋白质结合后，改变蛋白质的热稳定性。具体来说，当细胞或细胞提取物被分为多份，分别在一系列不同温度下加热后，与小分子结合的蛋白质会表现出更高的热稳定性，其热变性中点温度（Tm）会相应提高。1.不适用于热不敏感蛋白：一些蛋白质需要在极端的温度条件下才会表现出热稳定性变化，还有一些蛋白质与配体结合后不会明显改变其热稳定性，这种情况下用TPP的方法不可能将这些蛋白质识别。3.硬件上的局限性：TPP是基于质谱的蛋白组学测定，仍然是一种低通量方法，并且缺乏对低丰度蛋白质检测的敏感度。
2025-04-01 13:48:55
768
原创 CETSA技术的实验原理及流程
最终，利用蛋白免疫印记法（Western blotting），可以检测到与药物结合的靶点蛋白，从而验证药物与靶蛋白的相互作用。CETSA是一种前沿生物技术，无需标记或修饰蛋白质，可在生理条件下直接评估药物与靶点的结合。CETSA能够验证药物是否与预期的靶蛋白结合，通过比较药物处理组和对照组的蛋白降解情况，可以确定药物与靶蛋白的结合效率。在疾病的研究过程中，CETSA技术可用于组织裂解液，对比正常和病变组织蛋白质热稳定性差异，筛选生物标志物，如可以从肿瘤组织中筛选出热稳定性不同的蛋白质可用于肿瘤诊断。
2025-03-31 15:52:32
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原创 组学数据分析实操系列 | （六）蛋白相互作用域可视化分析
A：相比而言，小分子-蛋白对接的可靠性更高，而蛋白-蛋白对接因为蛋白结构较大，而且会有结构柔性变化，因此较难预测。通过图片，我们可以观察到ENOA与GAPDH的相互作用依赖于其相互作用界面的氨基酸残基，总共涉及到ENOA蛋白上的10个氨基酸残基与GAPDH上的9个氨基酸残基间的相互作用（如GAPHD的第45位TYR45与ENOA的第399位ARG399和第401位GLU401相互作用）（图12）。A：如果有完整序列的PDB结构，优先使用PDB结构，如果没有，则可以使用AlphaFold结构。
2025-03-31 10:41:57
655
原创 组学数据分析实操系列 | （五）蛋白互作网络分析（STRING + Cytoscape）
即Protein–protein interaction(PPI) network，是描述一组蛋白间相互作用关系的分析方式。因为蛋白间的相互作用关系复杂，每一个蛋白都是一个节点，多个蛋白间的相互作用连成线条就形成了网状结构，故称之为蛋白互作网络。分析蛋白互作网络的目的是什么呢？主要有两点：一方面自然是帮助我们明确蛋白之间的相互作用关系，这一点对于一些IP-MS研究很重要；另一方面，我们还能筛选出一些处于蛋白互作网络上关键节点的蛋白，这对于生物标志物的筛选具有指导意义。
2025-03-25 17:31:20
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原创 组学数据分析实操系列 | （四）蛋白互作网络分析（STRING + Cytoscape）
我们对今天的分享内容做一下总结，STRING数据库分析结合Cytoscape绘图是当下进行蛋白互作网络分析所使用的主流方法，对于PPI网络的美化及进阶处理可以多借助一些插件，细节部分则可以根据个人喜好进行调整，最后就能做出既美观又高端的蛋白互作网络图啦。分析的起点是一组蛋白（名称或者ID号），它们可以来源于我们蛋白IP-MS筛选出来的所有互作蛋白，也可以是我们差异分析所筛选出来的全部差异表达蛋白，通常50-300个蛋白可以获得较好的图形展示效果。这就是今天我们介绍的蛋白互作网络分析构建的全部内容。
2025-03-24 16:00:32
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原创 Cell子刊 IF48.8 | 绘制 949 种癌细胞蛋白质组全景图，AI 算法锁定千种潜在药物靶点
从更广泛的层面来看，蛋白质和转录测量之间的相关性在不同基因之间存在差异，整体相关性并不强，中位数蛋白质-转录组皮尔逊相关系数为0.42。研究结果显示，对来自28种组织和超过40种遗传和组织学上不同的癌症类型的949种人类癌细胞系的蛋白质组，进行了定量并构建了泛癌症蛋白质图谱。蛋白质水平和转录水平之间的整体相关性并不强，而蛋白质组数据更能够捕获转录后调控和蛋白质稳态网络的影响，且某些蛋白质的表达水平与基因突变状态密切相关，表明了蛋白质水平的研究对于理解癌症的分子机制具有重要意义。
2025-03-21 10:39:20
762
原创 组学数据分析实操系列 |（四） 富集气泡图的绘制
，我们介绍了利用Metascape零代码实现富集分析，但是Metascape的富集分析结果是以柱状图的形式展示的。”的形式外，该网站工具还提供了其它的富集分析结果可视化方式，下图展示的是其中两种形式。上一步点击后的页面分为两个部分，左边用于粘贴数据和调整参数，右边是对数据输入格式的说明。如果我们想把上述富集柱状图改为气泡图形式，或者在拿到富集分析结果表格后，经过调整阈值筛选进行重新绘图，该如何操作呢？这些工具提供了丰富的可视化选项，据以优化(富集) 分结果的展现形式，方便读者更好地理解和解释数据。
2025-03-19 14:28:39
1441
原创 如何轻松导出二级谱图？PDV工具来帮忙！
在搜索栏中输入目标蛋白的肽段序列或谱图编号（谱图编号可在搜库产生的combined文件夹中的evidence.txt文件的“MS/MS scan number”列中找到）。PDV（Proteomics Data Viewer）是一款基于java的可视化工具，它以简洁的界面和强大的功能，为蛋白质组学数据分析提供了极大的便利。在蛋白质组学研究中，二级谱图是鉴定蛋白质的“金钥匙”。找到目标谱图后，点击谱图下方的“Export”选项，选择“Spectra”可导出原始数据，选择“MGF”则生成对应的mgf文件。
2025-03-17 10:51:16
611
原创 盘点【2024年中科院2区中药方剂机制研究文章】思路及工作量
使用Sybyl 1.3和AutoDock Vina对Rg1与121个潜在靶点的结合能进行评估，筛选出19种高分蛋白（总分>5.0，结合能≤-7 kcal/mol），包括PAH，MAPK1，DAPK1，MMP8，PYGL，ADK等，这些蛋白可能是Rg1的潜在结合靶点。在这种背景下，如何在中药方剂的机制研究中脱颖而出，发表高影响因子文章？，展示GO富集分析条形图、弦形图，以及KEGG富集分析气泡图和桑基图，并将药物关键活性成分与核心靶点进行分子对接，揭示药物作用的分子机制及具体靶点信息，助力后续实验验证。
2025-03-14 15:02:15
1553
原创 LiP-MS与TPP——探索药物靶点筛选新路径
LiP-MS适用于精确检测小分子与蛋白质的结合位点及动态构象变化，而TPP擅长评估小分子对蛋白质整体热稳定性的影响。具体来说，小分子与蛋白质结合可能使蛋白质局部结构更紧密或松散，改变蛋白酶识别和切割的位点。通过比较药物处理组和对照组蛋白质酶切片段的差异，可识别出与小分子结合的蛋白质及其作用位点。TPP技术基于小分子与蛋白质结合后，改变蛋白质的热稳定性。2.基于蛋白质性质变化：都依赖于小分子与蛋白质结合后引起的蛋白质性质变化，LiP-MS关注构象变化导致的酶切位点可及性改变，TPP关注热稳定性变化。
2025-03-12 11:04:31
1176
原创 DGIdb：解锁“基因-药物互作”的精准医疗钥匙
DGIdb（Drug-Gene Interaction Database）是全球领先的基因-药物互作数据库，它允许用户搜索靶向特定基因的药物，涵盖美国食品及药物管理局（FDA）批准的药物、实验药物以及在研药物，并提供适应症、靶基因和相互作用类型等详细信息。无论是临床疑难病例的个体化治疗，还是基础研究中的靶点筛选，高效且精准的数据解读都是核心挑战。*图中展示了药物-基因相互作用，每个基因都与药物类别相连，每个线的宽度由每个类别中已知与每个基因相互作用的药物数量决定。1.2 它能解决什么问题？
2025-03-10 15:08:15
960
原创 LiP-MS：解锁疾病生物标志物的“密码”
LiP-MS技术以其独特的优势和强大的功能，为疾病生物标志物的发现和应用提供了全新的视角和方法。在当今的医学研究领域，疾病生物标志物的发现和应用对于疾病的早期诊断、治疗监测和预后评估具有至关重要的意义，传统诊断方法往往受限于对疾病标志物的敏感性和特异性不足，难以在疾病初期及时捕捉到关键的病理信息，从而使得许多患者在确诊时已错过最佳治疗时机。LiP-MS（有限蛋白水解质谱技术）作为一种新兴的蛋白质研究技术，以其独特的优势和强大的功能，能够从复杂的生命系统中精准识别出与疾病状态紧密相关的生物。
2025-03-06 11:01:04
949
原创 时间分辨有限蛋白酶解质谱法：揭示聚合物与蛋白质相互作用的利器
LiP-MS技术不仅在蛋白质与聚合物的相互作用研究中表现出色，还能够轻松拓展至蛋白质-蛋白质、蛋白质-小分子等更广泛的相互作用研究领域。展望未来，随着LiP-MS技术的持续进步与创新，我们有充分的理由相信，这一领域将迎来更多的突破与惊喜，为生物医学研究带来更为广阔的前景。然而，这些聚合物与蛋白质的相互作用机制尚不完全清楚。通过LiP-MS精确分析聚合物与蛋白质结合后的结构变化，该研究在研究干扰素α2a（IFN-α2a）与不同聚合物的相互作用时，LiP-MS揭示了聚合物在蛋白质表面的结合位点和结合强度。
2025-03-04 15:58:28
615
原创 LiP-MS：癌症早期诊断的新“曙光”
通过LiP-MS技术，研究者揭示了CALR突变导致的伴侣功能缺陷，影响了糖蛋白的折叠和成熟，特别是对髓过氧化物酶（MPO）的缺陷有分子层面的证据。LiP-MS技术在癌症早期诊断中具有重要的应用潜力，能够通过发现新型生物标志物、早期癌症筛查、个性化医疗以及技术优化与应用拓展等方面，为癌症的早期诊断和治疗提供强有力的支持。随着科学技术的飞速发展，一种名为。LiP-MS技术无需对研究的小分子进行化学修饰，避免了传统化学蛋白质组学方法中可能遇到的分子过大或活性降低的问题，增加了实验的可操作性和数据的真实性。
2025-03-03 16:08:11
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原创 DARTS技术：药物靶点筛选领域的“常青树”
自2009年首次被提出以来，DARTS技术已成功应用于多种药物和生物样本的靶标鉴定，并凭借其无需化学修饰、兼容复杂生物体系的技术优势，在药物发现、功能蛋白质组学及转化医学研究中持续发挥重要作用，成为迄今为止应用最广泛的靶点筛选方法之一。谱度众合是一家由武汉大学博士团队创办的科研服务企业，我们专注于利用质谱技术服务于生物标志物、药物靶点筛选、基础研究等蛋白质研究领域，我们在本专业细分领域持续深耕十几年，针对具体研究场景开发多种面向具体研究目的和论文发表需求的服务产品，助力于客户更轻松更高效的完成科研目标。
2025-03-01 11:30:00
863
原创 武汉大学生命科学学院与谱度众合（武汉）生命科技有限公司举行校企联培座谈会
武汉大学生命科学学院副院长刘星教授、生命科学学院周宇教授、产教融合中心秘书李丹阳老师、2024级校企联培卓工专项同学，以及谱度众合总经理陈希博士、技术总监韩强强博士、行政总监康娥女士共同参加了本次座谈会。会议由学院副院长刘星教授主持。会议伊始，刘星院长对谱度众合团队的到来表示热烈欢迎，并强调校企联培是学院推进专业学位研究生教育改革的重要举措。此次会议为校企联培工作奠定了坚实基础，双方将遵循优势互补、互利共赢的合作原则，持续优化培养方案，共同为生命科学领域培养更多优秀人才，推动生物与医药产业的发展与创新。
2025-02-28 09:47:19
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原创 iTSA与LiP-MS：药物靶点筛选的双子星
小分子药物与蛋白质结合后，会引起蛋白质构象的变化，这种构象变化会影响蛋白酶的切割位点可及性，从而在有限的蛋白酶解过程中产生靶蛋白的特异性片段。通过小分子药物与蛋白质的结合引起蛋白质构象的变化，这种构象变化会影响蛋白酶的切割位点可及性，从而在有限的蛋白酶解过程中产生靶蛋白的特异性片段。的蛋白，便可被识别为与药物直接相互作用的蛋白，从而找到药物结合的靶蛋白，为药物作用机制的研究提供关键线索。基于热蛋白组学技术，通过在特定温度下进行热处理，检测蛋白质的热稳定性变化，从而揭示药物与蛋白质的相互作用。
2025-02-27 11:30:45
544
原创 LiP-MS：揭开蛋白质翻译后修饰的神秘面纱
通过捕捉蛋白质在翻译后修饰状态下的构象变化，LiP-MS技术能够揭示翻译后修饰对蛋白质结构和功能的影响，为疾病机制研究和药物开发提供重要的线索。PTMs是细胞信号传导的重要组成部分，通过改变蛋白质的构象、定位、活性、稳定性、电荷和与其他生物分子的相互作用，最终影响细胞的表型和生物过程。LiP-MS（Limited Proteolysis Mass Spectrometry）即有限蛋白水解质谱技术，是一种通过小分子药物与蛋白质的结合引起蛋白质构象的变化，从而影响蛋白酶的切割位点可及性的技术。
2025-02-26 14:01:22
1270
原创 Nature Communications | 上皮性卵巢癌的蛋白质组学特征描述了不同组织学亚型的分子特征和治疗靶
浆液性癌（SC）特异性蛋白在细胞内运输和细胞通信中富集，如含蛋白的复合物定位和底物粘附依赖的细胞扩散（图6b）。除此之外，癌症标志的。显示，雌激素反应和氧化磷酸化标志蛋白在卵巢癌中表达上调，而凋亡、上皮间充质转化(EMT)、TNF-α信号通路和其他信号通路蛋白在卵巢癌中表达下调雌激素反应和氧化磷酸化标志在上调的蛋白质中过度表达，而细胞凋亡、EMT、通过NF-κB的TNFA信号传导等通路在EOC中下调的蛋白质中过度表达（图3d），这表明肿瘤细胞的增殖和转移可能是由这些异常的失调蛋白质和途径促进的。
2025-02-25 15:42:46
964
原创 药物筛选试验的两把利刃——LiP-MS和小分子pull down
LiP-MS技术正是利用这一原理，通过比较小分子药物存在和不存在时蛋白质的酶切图谱，来确定小分子药物与蛋白质的结合位点和影响范围。它通过将小分子药物与生物素等亲和标签偶联，形成小分子探针，然后利用链霉亲和素磁珠等固相支持物来“拉”下与小分子药物结合的蛋白质。在小分子pull down实验中，首先将小分子药物与生物素等亲和标签偶联，形成小分子探针。与小分子药物结合的蛋白质会被磁珠捕获，经过洗涤去除非特异性结合的蛋白质后，洗脱并鉴定捕获的蛋白质，从而确定与小分子药物相互作用的靶点蛋白。
2025-02-24 15:24:18
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原创 湖北中医药大学&谱度众合（武汉）生命科技有限公司研究生工作站揭牌
2025年2月11日，湖北中医药大学&谱度众合（武汉）生命科技有限公司研究生工作站揭牌仪式在武汉生物技术研究院一楼101会议室举行，湖北中医药大学研究生院院长刘娅教授、基础医学院院长孔明望教授、基础医学院赵敏教授、基础医学院研究生管理科科长丁凤敏老师、研究生院陈乔老师、以及谱度众合总经理陈希博士、技术总监韩强强博士、培训总监王亮节博士、研发工程师李鑫博士、行政总监康娥女士共同参加了本次揭牌仪式。随后研发工程师李鑫博士介绍了研究生工作站建设期间，由校企合作共同研发的“中药靶点及作用机制研究一站式解决方案”。
2025-02-24 14:04:51
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原创 一文读懂临床研究注册！（附ChiCTR超详细实操）
在临床研究的旅程中，有一个关键的步骤常常被新手研究者遗漏，那就是临床研究注册。国际医学期刊编辑委员会（ICMJE）明确要求："所有临床试验在入组第一个对象之前必须进行国际注册，否则不予发表试验结果”。当前全世界至少有近600种医学期刊要求进行临床注册。
2025-02-21 09:54:13
617
原创 化学蛋白质组学与药物靶点筛选：DARTS、LiP-MS、TPP、CETSA技术的深度解析
化学蛋白质组学技术的出现，为药物靶点筛选提供了强大的工具，化学蛋白质组学是一门研究细胞或组织中全部蛋白质的化学组成、结构、功能和相互作用的学科。由于小分子药物与蛋白质的结合可能引起蛋白质构象的变化，这种构象变化会影响蛋白酶的切割位点可及性，从而在有限的蛋白酶解过程中产生靶蛋白的特异性片段。LiP-MS 技术凭借其高分辨率的特点，能够精确检测小分子与蛋白质的结合位点，全面识别和检测多种类型的蛋白质-小分子相互作用，能够在接近生理条件下探测蛋白质的原位结构变化，揭示蛋白质在天然状态下的动态构象特征。
2025-02-20 16:04:11
1193
原创 LiP-MS：解锁中药奥秘的“钥匙”
具体来讲，生理状态下蛋白的动态变化会暴露出表面肽段的酶切位点，但是小分子药物与靶蛋白结合后，会在整体或者局部水平稳定蛋白的结构，这使得蛋白表面的肽段暴露和被蛋白酶酶切的可能性大大降低。在这个理论背景下，设置药物处理组与溶剂处理的对照组，同时以非特异性的蛋白酶进行处理，会在药物结合的靶蛋白上形成酶切位点（肽段）的差异，最后通过质谱检测来定量筛选出组间差异的肽段（蛋白），最终可以确认为药物作用的结合靶点。同时，每个项目均配备资深学术顾问和生物信息学专家，全方位助力您的科研成果发表，为您的研究保驾护航。
2025-02-19 11:25:34
887
原创 组学数据分析实操系列 |（四） 富集气泡图的绘制
在上一篇中，我们介绍了利用Metascape零代码实现富集分析，但是Metascape的富集分析结果是以柱状图的形式展示的。”的形式外，该网站工具还提供了其它的富集分析结果可视化方式，下图展示的是其中两种形式。上一步点击后的页面分为两个部分，左边用于粘贴数据和调整参数，右边是对数据输入格式的说明。如果我们想把上述富集柱状图改为气泡图形式，或者在拿到富集分析结果表格后，经过调整阈值筛选进行重新绘图，该如何操作呢？接下来在表格区域输入数据，注意这个数据的信息排布与前一个工具有所不同，第一列YData输入。
2025-02-18 14:26:30
1351
原创 网络药理学与LiP-MS：小分子药物研究的天合之作
LiP-MS的鉴定结果不仅验证了网络药理学分析的可靠性，还为深入理解夏枯草调节先天免疫反应的分子机制提供了重要线索，进一步揭示了其治疗HT的潜在作用靶点。网络药理学则是近年来兴起的一门新兴学科，通过整合多组学数据，网络药理学能够预测药物的潜在靶点、分析药物的作用机制，并探索药物与疾病之间的关联。如在研发某种时，网络药理学可以整合其中的靶点信息，构建出一个复杂的药物作用网络，帮助我们理解该药物的整体疗效。它们的结合将为小分子药物的研究带来更多的可能性，帮助我们发现更多潜在的药物靶点，开发出更有效的治疗方案。
2025-02-17 17:04:56
1270
原创 组学数据分析实操系列 | （三）Metascape零代码解锁富集分析
单个基因列表的富集分析结果示例如下，该图来源于2020年发表于Cell期刊的文章“Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera”。，这样我们可以更清楚地了解不同比较组中差异蛋白的功能情况，更好地理解差异蛋白在不同生物学过程和通路中的作用。，这种方法的最大优点是可以帮助用户综合分析差异蛋白在多个功能和通路上的富集情况，提供更全面的生物学解释。若只需要下载某个结果图，可以点击放大图片，点击左下角图标下载结果图。
2025-02-17 16:20:59
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原创 心动的本质是蛋白质的作用？从多巴胺到催产素，你的身体藏着多少「爱情激素」？
例如，国内一项研究表明，催产素可能通过多种途径降低心血管疾病的风险，同时还能通过调节自主神经系统，降低交感神经的兴奋性，从而减轻心血管系统的负担[2]。这些神奇的化学物质，宛如爱情的“信使”，在我们的大脑中穿梭，传递着爱的信号，操控着我们的情绪与行为。更令人惊讶的是，爱情激素的作用远不止于此。保持规律的生活习惯、积极的情绪管理以及亲密的社交关系，有助于维持爱情激素的平衡，从而促进身心的全面健康。让我们以科学的视角看待爱情，以健康的方式经营爱情，使爱情不仅成为生活中最美好的礼物，更成为我们健康的守护者。
2025-02-14 16:52:50
663
原创 分子对接——LiP-MS技术强力的帮手
二者的结合，就像理论与实践的完美融合：分子对接为LiP-MS提供了明确的实验目标和方向，而LiP-MS则为分子对接的预测结果提供了有力的验证和修正依据。具体来讲，生理状态下蛋白的动态变化会暴露出表面肽段的酶切位点，但是小分子药物与靶蛋白结合后，会在整体或者局部水平稳定蛋白的结构，这使得蛋白表面的肽段暴露和被蛋白酶酶切的可能性大大降低。随着技术的飞速发展、计算能力的显著提升以及质谱技术的持续突破，分子对接的预测精度将迈上新的台阶，而LiP-MS技术的检测范围和灵敏度也将得到进一步拓展。
2025-02-12 16:38:28
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原创 一文读懂|免疫沉淀串联质谱分析（IP-MS）全流程
IP-MS是研究蛋白质相互作用的一种常用技术，其核心原理基于抗原与抗体的特异性结合。IP效果评估产品基于样品中全蛋白和诱饵蛋白的质谱鉴定和定量数据评估IP实验成效，判断该样品是否满足进行互作蛋白筛选或动态互作组学的要求，在前期实验不理想的情况下尽快止损，并提供实验优化意见，以获得可靠和理想的IP-MS实验结果。动态互作组学产品通过不同条件下多个实验组样品与对照组样品间蛋白定量的差异，筛选出诱饵蛋白的相互作用蛋白，基于诱饵蛋白定量信息校正蛋白相互作用程度，并分析不同条件下蛋白相互作用程度的变化。
2025-02-10 09:16:32
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原创 组学数据分析实操系列 | （二）一键实现MaxQuant非标定量蛋白质组学搜库结果的生信分析
1）大家可选择上一篇文章中MaxQuant搜库得到的结果，或更简单的，选择LFQ-Analyst提供的示例数据Example LFQ data和Example Experimental Design file进行操作；比如，在火山图中画框选中感兴趣的点，图中会标注这些点的基因名，并在左侧数据表格中展示这些蛋白的信息。还有，在左侧LFQ结果表格中选择感兴趣的蛋白，右侧Protein Plot界面可针对这些蛋白绘制相应的箱图或小提琴图来显示其在不同样品中的定量差异。，方便我们对蛋白质组学数据进行理解和挖掘。
2025-02-07 21:30:00
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原创 组学数据分析实操系列 | （一）用MaxQuant软件对定量蛋白质组学数据进行数据库检索
以上就是使用MaxQuant软件进行定量蛋白质组学数据搜库的过程啦，这一步我们只是拿到了基本的定量数据，下一篇我们继续讨论拿到MaxQuant搜库结果后该如何展开下一步的分析。导入仅包含数据文件的文件夹。如果是TMT标记定量的蛋白质组学数据，设置上有一些不同之处，我们这里把需要重点调整的参数拎出来，其它基本操作过程与上述步骤类似。iBAQ是基于Intensity的强度值，除以该蛋白的理论可被检测的肽段数目计算而来的定量值，主要用于不同蛋白的相互比较。，MaxQuant开始搜库，该页面会显示详细的搜库状态。
2025-02-07 07:30:00
1336
原创 临床样本采集指南丨（三）细胞样本篇
在多中心和长周期项目中，使用统一的样本采集和保存方法格外重要，应在项目开展过程中组织多次的样本采集培训，以保证所有样本在取材部位、采集时机、处理过程等方面保持一致，减少样本在采集环节引入的差异。各研究课题的采样条件和研究目的具有较大区别，该样本采集方法仅适用于常见临床蛋白质组学实验方案，请在准备样本前联系我司销售，我司技术人员将会根据您的具体实验条件和研究目的为您制定专属的采集方法。样本采集符合代表性和准确性原则、一致性和可追溯性原则、迅速性和低温性原则、生物安全性和信息安全性原则等四条基本原则。
2025-02-06 21:00:00
1642
原创 药物靶点筛选的利器——LiP-MS
通过分析这些片段的变化，LiP-MS技术能够揭示蛋白质与小分子药物之间的相互作用及其引起的构象变化，为药物靶点筛选提供重要信息。此外，LiP-MS还可与其他组学技术（如蛋白质组学、代谢组学）相结合，提供更全面的药物作用机制和靶点网络信息，为药物研发提供多维度的数据支持。最终，通过质谱检测，我们可以鉴定并筛选出组间存在差异的肽段（蛋白），从而确认这些为药物作用的结合靶点。药物靶点筛选是药物研发和老药新用的核心环节，其目标是识别与疾病相关的关键生物分子靶点，为新药开发和现有药物的再利用提供重要方向。
2025-02-06 16:49:58
802
原创 临床样本采集指南丨（二）组织样本篇
在多中心和长周期项目中，使用统一的样本采集和保存方法格外重要，应在项目开展过程中组织多次的样本采集培训，以保证所有样本在取材部位、采集时机、处理过程等方面保持一致，减少样本在采集环节引入的差异。样本采集符合代表性和准确性原则、一致性和可追溯性原则、迅速性和低温性原则、生物安全性和信息安全性原则等四条基本原则。样本采集符合代表性和准确性原则、一致性和可追溯性原则、迅速性和低温性原则、生物安全性和信息安全性原则等四条基本原则。将样本迅速冻入-20 ℃冰箱短期保存，或-80 ℃冰箱长期保存，检测时干冰寄送。
2025-02-06 08:00:00
922
原创 临床样本采集指南丨（一）体液样本篇
样本在离体后应及时进行处理和低温保存；样本采集符合代表性和准确性原则、一致性和可追溯性原则、迅速性和低温性原则、生物安全性和信息安全性原则等四条基本原则。样本采集符合代表性和准确性原则、一致性和可追溯性原则、迅速性和低温性原则、生物安全性和信息安全性原则等四条基本原则。样本采集符合代表性和准确性原则、一致性和可追溯性原则、迅速性和低温性原则、生物安全性和信息安全性原则等四条基本原则。样本采集符合代表性和准确性原则、一致性和可追溯性原则、迅速性和低温性原则、生物安全性和信息安全性原则等四条基本原则。
2025-02-05 13:45:51
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空空如也
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