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RSS订阅原创 靶点验证四步走（一）｜靶点功能验证：从“差异信号”到“因果证据”，教你给疾病靶点 “定罪”！
本文介绍靶点验证四步走，重点讲功能验证方法，包括基因敲除、蛋白表达及通路分析，帮助科研人员筛选有效靶点。
2025-12-05 09:00:00
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原创 实验Protocol检索秘籍 | 从权威数据库到技术资料平台的超全盘点
今天这份超全检索指南，整合了四大类“宝藏资源”——从权威文献到标准化数据库，从科研社区实战技巧到厂家专属说明书，再加上高效检索策略，帮你快速锁定高质量实验方案，把时间花在真正的研究上，成功率直接翻倍（结尾附检索网址，赶紧收藏码住）！
2025-12-04 09:00:00
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原创 突破！LiP-MS+TPP 解锁渗透剂维稳密码，开启蛋白质组研究全景时代
在极端环境中，沙漠啮齿动物能抵御干旱，深海生物可耐受高压 —— 这些生命奇迹的背后，藏着一种名为 “渗透剂（Osmolytes）” 的 “分子盾牌”。它们是生物体应对逆境的核心武器，从早期被观察到的 “相容性保护” 现象，到如今成为生物技术领域的研究热点，渗透剂的神秘面纱正被两项关键技术逐步揭开。今天，我们就来聊聊有限蛋白酶解质谱（LiP-MS）与热蛋白质组分析（TPP）如何颠覆渗透剂研究范式，带来从机制解析到产业应用的全链条突破。
2025-12-03 09:00:00
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原创 蛋白质组学技术（ PL-MS/ TPP/LiP-MS）赋能外泌体载药
当外泌体被贴上 “天然纳米快递车” 的标签时，研究者往往先兴奋后头疼：兴奋的是它天生会穿组织、躲免疫细胞的 “检查”；头疼的是同一批 “快递车” 里，有的能把药送到目的地，有的半路被免疫细胞（比如巨噬细胞）“没收”，有的干脆连 “目的地大门” 都找不到。所以写论文到关键机制部分，常被审稿人问 “没证据证明药和靶点真结合了”“没验证靶点结合后有没有变样子”，卡得死死的。问题说到底：我们习惯了看 “蛋白数量变多还是变少”，却忽略了 “药到底有没有抱住靶点”“抱住后靶点有没有变形状” 这两件更根本的事。
2025-12-01 16:39:42
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原创 一文掌握金属结合蛋白研究：X 射线/ NMR/METAL-TPP，参数对比 + 决策路径全梳理
作为长期深耕金属结合蛋白（MBPs）领域的博士生，踩过不少技术选择的坑 —— 最初面对 X 射线晶体学、NMR、ICP-MS 等一堆方法无从下手，后来接触到北大团队开发的 METAL - TPP 新兴技术，才慢慢摸清不同场景下的最优解。今天把自己整理的研究笔记分享出来，从传统技术到前沿方法，从技术细节到实验策略，帮同为研究者的你少走弯路。
2025-12-01 08:30:00
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原创 基于传统Co-IP/ Y2H与新兴SPR、BLI、TPP、PL-MS、LiP-MS技术的蛋白背景降噪指南
蛋白互作研究的核心痛点，一半来自 “抗体依赖带来的背景噪音”。传统方法优化后能保底，但要突破瓶颈、加速新药研发，“不依赖抗体” 的新兴技术才是关键 —— 它们从源头降背景，还能解决传统方法做不到的动力学、构象、活细胞互作问题。不用盲目追求 “最贵的技术”，根据项目阶段（筛 / 验 / 析）选对工具，甚至组合使用，才能真正少走弯路。
2025-11-28 08:30:00
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原创 整合PISA、CLIP与AP-MS技术，全面解析RNA-蛋白互作机制
做 RNA - 蛋白互作研究久了，会发现不同类型 RNA 的研究思路既有共通之处，又藏着各自的 “门道”。
2025-11-27 10:14:03
537
原创 Nature拆解 | 热蛋白组分析技术TPP改写大肠杆菌必需蛋白传统研究逻辑
必需蛋白碰不得、蛋白互作 “体外失真”、突变体表型 “知其然不知其所以然”，几乎是每个大肠杆菌研究者都会遇到的坎。直到 2018 年看到《Molecular Systems Biology》上那篇把 TPP 技术用到细菌上的文章，再到 2020 年《Nature》发布的规模化 TPP 数据集，我才突然意识到：原来这些困扰多年的难题，早就有了 “无创破解” 的思路。
2025-11-26 08:30:00
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原创 蛋白纯化标签选择指南②：攻克复杂纯化！3 组对比 + 4 大策略，搞定高纯度蛋白
最后浓缩为 “3 步决策法”，帮你快速锁定最优标签：▶ 定边界：明确宿主系统、下游应用、核心需求（纯度 / 产量 / 活性），排除不兼容标签。▶ 筛候选：根据蛋白特性（溶解性 / 敏感性），从兼容标签中筛选 2-3 个候选。▶ 做优化：用双标签、可切除标签等策略弥补候选标签短板。举个例子：哺乳动物细胞中纯化 mg 级、纯度 95% 以上的酸性敏感酶 ——定边界：真核系统、体外酶活、高纯度高活性→排除 CBP、FLAG。
2025-11-25 09:00:00
531
原创 蛋白纯化标签选择指南①：7 类常用标签 + 5 步选择法
从事重组蛋白表达与纯化研究最常被实验室后辈问的问题就是：“我这个蛋白该用哪个标签纯化？” 其实标签选择没有 “标准答案”，但只要吃透每种标签的特性、结合实验需求拆解，就能少走 80% 的弯路。今天先带来连载第一篇，从 “常用标签认知” 和 “选择核心逻辑” 入手，帮你打下基础，明天再讲标签对比与进阶技巧～
2025-11-24 09:19:50
855
原创 邻近标记技术PL-MS | 解锁泛素化“酶 - 底物”连接密码
长期以来，研究者们始终被一个难题困住：如何精准捕获 E3 泛素连接酶和去泛素化酶（DUB）的 “直接搭档”—— 底物？传统方法要么混淆直接与间接互作蛋白，要么对低丰度底物束手无策。而邻近标记技术的横空出世，就像给研究者装上了 “分子显微镜”，让酶与底物的隐秘联系无所遁形。今天，我们就来系统拆解这项技术如何重塑泛素化研究格局。
2025-11-21 08:30:00
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原创 蛋白质组学分析②：从静态到动态！用桑基图& GSEA & Mfuzz & PPI 深挖数据深层机制
摘要：本文系统介绍了四种复杂组学数据的可视化分析方法，包括桑基图、GSEA图、Mfuzz时序聚类图和PPI网络图。
2025-11-20 08:30:00
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原创 IF：100+ 两篇顶刊拆解 | TPP热蛋白组分析破解癌症药物 “体内失效” 核心难题
摘要： 两项重要研究为解决抗癌药物研发中的靶点验证、脱靶效应等痛点提供了实用工具与方法。
2025-11-19 09:00:00
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原创 蛋白质组学生信分析①：入门必看！火山图 + GO/KEGG 气泡图搭建生信分析基础框架
本文系统介绍了组学数据分析中的三种基础可视化方法：火山图用于筛选差异表达基因，通过横纵坐标展示表达变化与统计显著性；GO富集气泡图揭示差异基因的生物学功能，通过气泡大小和颜色展示富集程度与显著性；KEGG富集气泡图定位差异基因参与的代谢通路。文章详细解析了各图表的展示形式、分析目的、解读方法和常用工具，建立了从差异筛选到功能通路分析的完整逻辑链，为生物医学研究的组学数据可视化提供了实用指导。
2025-11-18 08:30:00
941
原创 Cell重磅细胞周期研究指南 | TPP三步跳出 “仅看蛋白丰度” 的认知陷阱
在细胞周期研究领域，我们曾长期依赖 “蛋白质丰度” 解读调控逻辑 —— 以为找到 “某阶段增多 / 减少的蛋白”，就能破解细胞分裂的密码。直到两篇发表于《Cell》的研究，用一套更精准的 “蛋白状态检测法”，撕开了细胞周期的隐藏调控层。今天我们就以这两项研究为核心，复盘其研究思路、关键新发现，以及背后技术如何悄悄改写了我们对细胞周期的认知。
2025-11-17 09:00:00
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原创 用14个天然药物靶点筛选案例教会你，DARTS/SPROX/CETSA/TPP 到底怎么选？
本文系统比较了DARTS、CETSA、SPROX和TPP四种无标记技术在天然药物靶点筛选中的应用特点。
2025-11-14 08:30:00
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原创 激酶找不到底物？底物追不上激酶？IP-MS 联合修饰鉴定组学突破瓶颈
做激酶 - 底物互作研究的这些日子，我算是被传统方法 “磨” 得没了脾气 —— 想找已知激酶的直接底物，免疫沉淀、体外激酶实验轮番上阵，还要多轮验证排雷，可假阳性依旧扎堆，低丰度的磷酸化肽段根本抓不住，更别提精准定位修饰位点；反过来追已知底物的上游激酶，更是要堆砌多种技术，步骤繁琐到让人崩溃，却始终摸不清关键的调控链路....
2025-11-13 08:30:00
1274
原创 药物靶点研究 | CETSA vs. TPP ，从 “单点验证” 到“全景扫描”的飞跃
热蛋白组分析(TPP)与细胞热迁移分析(CETSA)是药物靶点研究的两种关键技术。TPP作为CETSA的质谱延伸版本，能一次性扫描数千种蛋白，适合未知靶标发现；而CETSA则专注于单点验证，更适合已知靶标确认。关键差异体现在：TPP覆盖5000-8000种蛋白，数据解析复杂但发现能力强；CETSA操作简便，适合少量样本验证。实验策略上，TPP用于系统筛选未知靶点，CETSA则验证特定互作。最新发展显示TPP正向定量靶标占有率检测进化，两者互为补充，共同推动精准药物研发。
2025-11-12 08:30:00
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原创 【靶点预测第②弹】OMIM/GeneCards/DrugBank/GEO 等七大靶点数据库实操指南
这篇指南详细拆解了7大疾病靶点数据库（OMIM、GeneCards、DrugBank等）的核心功能与使用流程，提供step-by-step检索方法、关键信息提取技巧和数据导出方案。
2025-11-11 08:30:00
2009
原创 热蛋白组分析赋能植物研究 | PISA/CETSA-MS 破解代谢物 - 蛋白互作与激素信号之谜
热蛋白组分析技术为植物研究带来突破性进展。该技术通过监测蛋白与小分子结合后的热稳定性变化，实现无偏见的蛋白互作筛查。两项代表性研究展示了其在植物领域的应用价值：PISA分析针对叶绿体代谢物-蛋白互作，通过优化分离和标记策略，成功筛选出抗坏血酸的关键作用靶点；CETSA-MS则突破细胞壁障碍，结合磷酸化组学解析了油菜素内酯与生长素的协同调控机制。这项技术具有高通量、无需遗传改造、适配植物特殊结构等优势，未来将在作物育种、抗逆机制研究等领域发挥重要作用，为理解植物分子互作提供了全新工具。
2025-11-10 09:37:56
1491
原创 【靶点预测第①弹】超全疾病 - 靶点核心数据库分类指南
本文介绍了三类常用的疾病靶点预测数据库工具：1）基因-疾病关联数据库（OMIM、GeneCards、DisGeNET）用于寻找疾病相关基因；2）药物-靶点关联数据库（DrugBank、TTD、DGIdb）帮助建立药物与靶点关系；3）基因表达数据库（GEO、GTEx、ArrayExpress）挖掘表达差异线索。文章强调根据研究需求组合使用这些数据库，可大幅提升靶点筛选效率，并预告下期将提供具体实操指南。所有数据库链接均附在文末供参考。
2025-11-07 11:02:21
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原创 TPP热蛋白组分析技术 | 助力止咳药抗肺纤维化 /驱虫药抗癌，老药新用竟如此简单？
在医药研发领域，“老药新用” 一直是绕不开的黄金赛道 —— 跳过漫长的安全性验证，直接挖掘现有药物的新潜力，可大幅缩短研发周期、降低风险。但最大的瓶颈始终是：找不到老药的新作用靶点，不知道它能如何作用于疾病通路。而热蛋白组分析（TPP）技术的出现，彻底打破了这一僵局。它就像给科研人员装上了 “火眼金睛”，能在活细胞内精准捕捉老药的作用靶点，让老药新用从 “靠运气” 变成 “有方向”。
2025-11-06 08:30:00
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原创 蛋白样本制备选型指南 | 活细胞or裂解液怎么选？5 类样本全解析，适配场景一篇全知晓！
很多研究者既会在活细胞、细胞裂解液等样本间纠结，又困惑于方法学搭配，担心踩错适配陷阱，今天就一次性讲透 5 类样本的核心特点、适用场景和避坑要点，再深度解析配套方法学（样本制备 + 数据处理 + 时间成本），帮你精准匹配研究需求，一站式搞定靶点筛选，让效率翻倍！建议收藏转发，实验中随时查阅～
2025-11-05 09:09:25
662
原创 TPP热蛋白组分析：样本全覆盖-温度梯度设置指南，精准捕获作用靶点
热蛋白组分析（TPP）作为筛选药物靶点、解析蛋白热稳定性的核心技术，实验成败的关键往往藏在 “温度梯度” 这个细节里 —— 选对温度范围、间隔和加热条件，才能精准捕获蛋白熔化曲线，避免数据 “失真”。今天就带大家来拆解不同实验场景下的温度梯度设置逻辑，从活细胞到微生物，从粗略筛选到精准测 Tm，废话不多说，干货直接拿走去用～
2025-11-04 09:58:56
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原创 【干货拆解】热蛋白组分析TPP助力拟南芥抗热研究：两篇里程碑研究解锁植物蛋白抗热密码！
哪些蛋白是扛住热浪的 “耐热勇士”？蛋白的结构、互作又如何影响抗热能力？热蛋白组分析（Thermal proteome profiling，TPP）正是解锁这些谜题的关键。
2025-11-02 10:00:00
736
原创 中药活性成分研究②｜中药成分-靶点核心数据库实操手册
前两天咱们盘完了5 个核心中药数据库，是不是已经对“用哪个库干哪件事” 心里有谱了？今天小谱又带着“手把手实操指南” 来了 —— 每个库的操作步骤都拆得明明白白，还加了我踩过的坑（比如下错文件格式、漏选筛选条件），跟着做保准能快速拿到成分、靶点这些关键数据，科研效率直接拉满！
2025-11-01 10:00:00
1474
原创 中药活性成分研究①｜五个中药成分靶点数据库大盘点（TCMSP/TCMID/SymMap/HERB/台湾中药库）
中药里的成分多到像开盲盒，有效成分混在一堆非有效成分里，光靠文献瞎找根本效率太低！后来才发现，选对数据库比啥都重要，就像给实验装了 “导航”，直接精准定位有用信息～
2025-10-31 08:30:00
1470
原创 药物靶点筛选不迷路！TPP 热蛋白组分析 4 大技术选型指南
TPP 家族藏着 4 大核心技术，那他们各自适配怎么样的应用场景呢？今天就带大家用 “技术性格 + 场景匹配 + 顶刊案例” 的干货组合，吃透 TPP 技术选择逻辑，不管是初筛化合物、深析机制，还是临床样本分析，都能找到专属方案～
2025-10-30 09:47:43
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原创 中药靶点筛选实战指南：已知成分新适应症验证 vs. 未知成分高通量筛选，LiP-MS 关键破局！
中药活性成分是新药研发的“富矿”，但“不知道成分如何起效、找不到直接作用靶点”一直是制约中药现代化的关键瓶颈。近年来，随着质谱技术的发展，有限蛋白酶解 - 质谱联用技术（LiP-MS） 为中药活性成分的靶点筛选提供了高效解决方案。今天小谱带大家通过两篇顶刊研究 —— 分别聚焦“已知中药活性成分的新适应症验证” 和“未知中药活性成分的高通量筛选“，拆解中药靶点筛选的两种核心思路，顺便看看 LiP-MS 技术如何成为连接中药成分与疾病机制的“桥梁”。
2025-10-28 19:30:00
1059
原创 TPP热蛋白组分析：从操作到分析零门槛的实操指南
今天这份整合了顶刊经验、标准 protocol 的保姆级攻略，把复杂实验拆成 6 步直接抄，连避坑细节都标好了！新手也能照着做，少走 90% 的弯路，发高分论文的机会这不就来了？！
2025-10-28 15:33:09
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原创 从偶然发现到精准“捕猎”：热蛋白质组分析（TPP）的十年传奇
热蛋白组分析（Thermal Proteome Profiling, TPP）这项 “科研神器”，用十年时间彻底改写了药物与蛋白质研究的游戏规则！
2025-10-28 08:30:00
580
原创 SPR 实验笔记：从原理到实操，解锁天然产物筛选、靶点验证与膜蛋白互作的“金标准”技术
面等离子体共振（SPR）技术凭啥能写入中美药典，成为生物分子互作研究的 “金标准”？答案藏在它的三个核心优势里：无标记干扰（避免荧光标记破坏分子活性）、实时动态监测（全程记录结合 - 解离全过程）、定量精度高（精准计算亲和力参数）。更关键的是，它能解决科研中的三大痛点：从中药提取物里 “钓” 活性成分、验证药物与靶点的直接结合、破解膜蛋白与小分子的互作谜题。这篇笔记就带你吃透 SPR 的原理、实操和前沿应用。
2025-10-27 18:30:00
1061
原创 LiP-Smap vs. LiP-Quant：药物靶点筛选怎么选？3个问题加实操指南帮你精准决策
做药物靶点筛选、代谢物 - 蛋白互作研究时，你是否纠结过：同样是基于有限蛋白酶解（LiP，Limited Proteolysis）的质谱技术，LiP-Smap（单剂量有限蛋白酶解 - 质谱映射技术）和 LiP-Quant（多剂量有限蛋白酶解 - 质谱定量技术）到底该怎么选？前者快、省样本，却怕假阳性；后者准、能测亲和力，却耗资源 —— 今天帮你把两者的核心差异拆透，再给出生死抉择的「黄金参考」，让你的实验少走弯路！
2025-10-27 08:30:00
2022
原创 蛋白互作数据库深度解析：STRING vs. BioGRID vs. IntAct，如何选择你的科研利器？
三大主流PPI数据库深度对决：STRING, BioGRID, IntAct
2025-10-26 19:00:00
1688
原创 植物蛋白提取指南：干法分馏、湿法分馏与绿色提取在豆类 / 谷物蛋白及植物基食品中的应用
全球植物基食品市场预计2033年达359亿美元，植物蛋白提取技术成为关键。本文系统梳理了植物蛋白提取三大技术路径：干法分馏适用于淀粉蛋白差异大的原料，节能环保；湿法分馏（如碱提酸沉）得率高但能耗大；绿色技术（酶辅助、超声、深共熔溶剂）兼具环保与功能性优势。技术选型需综合考虑原料特性（溶解度分类）、实验需求和成本效益，同时关注可持续性指标。指南特别指出，未来研究可探索干法与绿色技术的组合应用，实现效率与环保的双赢。
2025-10-26 10:00:00
677
原创 蛋白质组学技术揭秘帕金森病：LiP-MS、BAR、UltraID - LIPA 助力 α- 突触核蛋白研究
最新蛋白质组学技术为帕金森病研究带来突破性进展。LiP-MS技术能精准捕捉α-突触核蛋白(α-syn)等蛋白的结构变化，揭示其异常聚集机制；BAR技术可绘制α-syn的特异性相互作用网络图谱，区分不同神经退行性疾病；UltraID-LIPA技术实现了活细胞内α-syn聚集过程的动态追踪，发现其早期寡聚化与膜结合细胞器的关键作用。这些技术从结构、空间和时间三个维度共同构建了帕金森病分子机制的"全景图"，为疾病诊断标志物开发和靶向治疗提供了新思路。
2025-10-25 19:00:00
735
原创 植物研究技术指南：PL-MS 与 LiP-MS 解析蛋白质互作、代谢物 - 蛋白结合及抗逆分子机制
做植物研究的小伙伴，是不是常陷入这样的困境？想找蛋白之间的弱互动，亲和纯化一洗就丢；想抓代谢物和蛋白的“悄悄话”（PMI），假阳性又高得离谱；好不容易拿到数据，却分不清是“真互动”还是“凑热闹”……别慌！邻近标记（PL-MS）和有限酶解质谱（LiP-MS），这俩“神器”刚好互补，一个擅长解锁蛋白的“社交圈”，一个专听代谢物与蛋白的“私密对话”。今天就带大家就拆透它们的植物应用，最后再聊聊“双剑合璧”的未来！
2025-10-25 10:00:00
1378
原创 从 “分子大象” 到 AI 赋能：LiP-MS 技术如何改写蛋白质研究的百年传奇？
今天要讲的这项技术，就像给研究者装上了 “鹰眼”，能看穿成千上万种蛋白质的动态变化。它就是结构蛋白质组学领域的明星 ——有限蛋白水解 - 质谱联用技术（LiP-MS） 。但这项尖端技术并非 “横空出世”，它的背后是一段跨越近百年的科学传奇，凝聚着几代科学家的智慧、远见，甚至 “艺术感”。
2025-10-24 17:30:00
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原创 标注可用于IP≠实战可用——超50%的IP抗体实际效果欠佳，如何实现0风险IP实验？
【科研抗体质量堪忧，IP实验需谨慎验证】研究表明，50%商业抗体未能通过标准化验证，IP实验中抗体靶蛋白检测率仅39%-54%。Nature报道显示，部分高引用论文使用的抗体实际无法识别目标蛋白。WB分析存在局限性，无法全面评估IP抗体质量，建议结合质谱等多方法验证。为降低实验风险，应重视抗体预评估和数据质量控制，推荐采用标签抗体IP、邻近标记技术等替代方案。专业团队指导可显著提升实验成功率，需建立系统性质控体系确保数据可靠性。
2025-10-24 17:07:11
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原创 用同样的方法找靶点，为啥别人发 15 分你发 5 分？这 4 个“上分细节”藏着答案
小谱最近扒了这两篇 “同题作文”，发现高分的秘密根本不是 “技术更牛”，而是人家在“研究设计、靶点验证” 这些细节上，把容易出问题的 “雷区” 变成了提升文章说服力的 “加分项”。今天用大白话拆解关键技巧，帮你避开那些拉低文章档次的坑，下次投稿直接冲刺更高水平！
2025-10-24 09:30:00
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