- 最近接了一些细菌和真菌做RNA-seq的项目,有客户提到想要获取核糖体RNA(tRNA)的统计结果,之前用sortmerna一个样品都要比对4,5个小时,打算试试tRNAscan-SE。不过安装过程卡了半天,一是官网没有安装说明,二是该软件的安装教程最新也是2017年的,版本和安装方式已经发生了变化。特此写下这篇文章,作为记录。
- 软件名称:tRNAscan-SE
- 官网地址:tRNAscan-SE Search Server (ucsc.edu)
- 下载链接:tRNAscan-SE-2.0.7.tar.gz (ucsc.edu)
- 对文件进行解压缩:
- gunzip trnascan-se-2.0.7.tar.gz
- tar -vxf trnascan-se-2.0.7.tar
- 这里就是卡住的点,其他教程说的需要手动或者命令行修改Makefile文件里的$HOME路径,实际上在2.0版本中Makefile不仅有两个文件(.in .am,./configure后会生成
2020.11.12丨tRNAscan-SE-2.0最新安装流程
最新推荐文章于 2021-10-30 21:13:21 发布