Seurat
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hyena_7
这个作者很懒，什么都没留下…
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R语言：读取loom文件，以及loom文件转成Seurat对象
使用satijalab开发的loomR读取loom文件，具体详见https://satijalab.org/loomr/loomr_tutorial。原创 2022-09-05 20:06:33 · 4205 阅读 · 1 评论 -
Cell Hashing简述
CellHashing和CITE-seq的测序原理基本一样，只是换了一个应用场景。它解决的问题是如何将不同样本的细胞混起来测序（便宜），测完了还能区分哪个细胞来源于哪个样本，这样做也减少了批次效应。...原创 2022-07-26 20:03:06 · 582 阅读 · 0 评论 -
随笔-对单细胞scRNA-seq进行质控
人类参考基因中线粒体基因是以“MT-”开头的，而在小鼠中是以“mt-”开头的原创 2022-07-10 14:13:37 · 836 阅读 · 0 评论 -
单细胞转录组高级分析： 多样本合并与批次校正
https://cloud.tencent.com/developer/article/1692238原创 2021-11-22 14:39:45 · 3015 阅读 · 0 评论