
统计学
hyena_7
这个作者很懒,什么都没留下…
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TWAS论文中的名词解释 (持续更新)
The alternative hypotheses:备择假设。The null hypotheses:零假设。原创 2023-05-22 11:30:26 · 209 阅读 · 0 评论 -
统计模型——贝叶斯统计模型,负二项分布
贝叶斯学派不太关心正确的参数到底是多少,而是需要通过获取的数据加上先验知识得出后验概率进行统计推断。比如想推断学校的男女比例,随机抽样了10个人,其中2男8女,频率学派会得出男生占20%的结论,因为样本就是证据,有且仅有的证据。当然,如果样本量更大,那肯定更接近于真实值,但在现实生活中,有时候样本的获取成本非常高,或者因为各种原因无法获取。贝叶斯方法则会考虑先前经验,比如前几年的调查数据,或者专家知识(这是一所理工大学,男女比例1:9),这些都作为先验概率参与后验概率的计算。原创 2022-11-02 13:48:54 · 851 阅读 · 0 评论 -
p-value,q-value,FDR
假阴性错误(false-negative errors): 高水平的基因可能偶尔没有检测到假阳性错误(false-positive errors): 低水平表达的基因由于扩增偏差,可能显得过于丰富,导致假阳性错误 一、P值和q值的定义P值(P-value) 即概率,反应某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法得到的P值,通常以P<0.05为显著,P<0.01为极显著,其含义为:抽样误差导致的样本间的差异的概率小于0.05或0.01。 根据定义,P值可简单理解为判.原创 2021-06-26 11:25:30 · 19668 阅读 · 1 评论 -
根据DNA序列预测TF
1.如何根据染色体坐标快速得到基因组的 DNA 序列:samtools faidx hg19.fasamtools faidx hg19.fa chr17:79988101-79990060得到fasta格式的序列2.根据fasta格式的序列,得到对应的TF:https://cloud.tencent.com/developer/article/1481942...原创 2021-06-06 11:25:54 · 326 阅读 · 0 评论