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表达数量位置的基因座，它指的是染色体上一些能特定调控mRNA和蛋白表达水平的区域，其mRNA/蛋白质的表达水平量与数量性状成比例关系。定义：对于多个个体在全基因组范围的遗传变异多态性（SNP）进行检测，获得基因型，将基因型与表型进行统计学分析，根据显著性等关系筛选出最有可能影响该性状的遗传变异，目的是通过这种方法找出与变异相关的基因。eQTL分析的本质是以全部的DNA变异位点为自变量，轮流以每种mRNA表达量为因变量，用大量的个体数据做样本进行线性回归，得到每一个SNP位点和每一个mRNA表达量间的关系。

多模态就是同时测一个细胞的多个信息，多组学是指多个组学，不一定来源于同一细胞

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https://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%A5%9E%E7%BB%8F%E5%85%83%E8%BF%81%E7%A7%BB

BMMC(bone marrow mononuclear cell)：是包括单核细胞，淋巴细胞，造血干细胞和祖细胞在内的具有单个核的细胞混合群体（无红细胞和粒细胞）。PBMC(peripheral blood mononuclear cell):注意这里是mononuclear cell单个核细胞，而不是Monocyte单核细胞,是指任何拥有圆形的细胞核的外周血细胞，这些细胞包括淋巴细胞（T细胞、B细胞、NK细胞）和单核细胞，而红血球和血小板由于没有细胞核不属于此类，粒细胞（包括中性粒细胞, 嗜碱性粒细胞

沃丁顿表观遗传景观(The Waddington’s epigenetic landscape) 是描述基因调控下细胞分化的动态性的一个经典的隐喻，是由沃丁顿在1957年提出的。他将细胞分化比喻作从高处沿山坡滚落下的小球，直到一个稳定的盆地 (basin)，该盆地也就代表一定的分化状态。小球最开始能量较高，处于不稳定状态，对应干细胞等未分化的细胞状态，小球最终滚落于低能量的盆地，较稳定，对应分化后的细胞。小球（干细胞）沿着不同的路径最终可以进入不同的盆地（分化为不同的细胞）。图示如下：...

胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESCs)是来源于早期胚胎的全能性细胞,在合适条件下具有分化为任何一类成体细胞的潜力.在小鼠中,根据细胞来源的胚胎发育时间,ESCs可以被分为原始态多能性(nalive pluripotency)和始发态多能性(primed pluripotency)两种状态.这两种状态的细胞在发育上相互联系,具有不同的形态,信号依赖,发育性质,基因表达及表观遗传学性质,并且在特定的条件下可以相互转化.人类胚胎干细胞(human embryonic stem cell

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安装 runipy pip install runipy终端执行ipynbrunipy <文件名称>.ipynb

协变量（Covariate）:在实验的设计中,协变量是一个独立变量(解释变量,indenpendent variable),不为实验者所操纵,但仍影响响应（response），例如年龄。总结：协变量是会对实验结果产生影响，但不可控的变量。...

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