watermel__的博客

在细胞生物学中，前体细胞（英语：precursor cell，也被称为母细胞，blast cell）是指已经部分分化的细胞，其分化潜能仅为单能性，较祖细胞更少。前体细胞可视为从干细胞分化到具体细胞的最后一步...

在用ArchR得到cell cllusters后，因为不可能事先知道每个聚类是哪个细胞类型，通常需要手动注释（因为每个数据集都不同）。为了进行细胞类型注释，我们使用细胞类型特异性标记基因的先验知识，并通过基因评分从我们的染色质可及性数据中评估这些基因的基因表达。基因评分本质上是根据基因附近调控元件的可及性对高表达基因的预测。...

CD34是糖基化的跨膜蛋白，是原代血细胞和骨髓来源祖细胞（尤其是造血细胞）的典型表面标记。尽管CD34+细胞的功能现在还不清楚，但研究表明，CD34+细胞涉及维持造血祖细胞的未分化状态。CD34+细胞适用于一系列研究，如直接诱导分化成各种相对成熟谱系血细胞。CD34（小鼠、大鼠的同源蛋白写作Cd34），是一类分化簇（Cluster of differentiation,CD）分子，在人体内由CD34基因编码，主要用来鉴定造血干细胞（HSC）等成体干细胞。CD34化学本质为糖蛋白，正常情况下位于细..

http://www.ensembl.org/biomart/martview1.Dataset选择2.Filters（过滤和输入）提交有Gene ID的文件3.Attributes选择输出的参数（期待的输出参数）4.Count可以看到匹配的基因数量（我原本的文件就是947个gene id）5.Results输出结果（可导出文件）...