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假设对一段2000 bp（G：测序目标区域大小）的目标序列进行单端测序，得到1000条reads（N：读段数目），每条reads 200bp（L：读段长度），测序后把所有的reads比对到目标区域后，若2000bp的目标区域中有1800bp的位置至少有1个read覆盖到，而剩余的200bp没有任何read覆盖到，如果RNA-seq的目标是发现新的稀有的转录本，如noncoding RNA或mRNA新的可变剪接，考虑到这些转录本的低表达和建库方案产生的偏差，估计需要超过400 M reads。

补充一下抗原呈递的部分，因为T细胞是不能直接识别抗原的，需要抗原呈递细胞（APC）把抗原处理成抗原肽-MHC分子复合物并结合在APC表面，然后与T细胞膜表面的TCR结合完成抗原的识别。若这个T细胞是辅助T细胞的话，就激活B细胞以释放抗体。若是细胞毒性T细胞则直接杀死病原体。MHC：这是一种能与肽段结合的蛋白复合物，通过呈递抗原肽向T细胞反馈TCR基因是人类基因组中复杂度最高的基因，也是变异程度最高的基因。这个复杂度主要源自3个因素：组成的多样性：成熟TCR的VDJC/VJC结构，是通过复杂的重.

Next-Generation Sequencing Analysis Resources（高通量测序技术分析资源）Pre-Requisites（基础要求）Intro to R (R简介)Introduction to Linux（Linux简介）Linux Exercise（Linux训练）Nano Tutorials（Linux编辑器 Nano教程）NGS Sequencing Technology and File Formats(高通量测序技术和文件格式)How Se

首先明确单细胞测序技术不一定是高通量的，有单细胞测序技术，高通量测序技术，包括高通量测序技术在内的所有高通量技术，用于单细胞测序的高通量技术。如果我们要从技术层面理解单细胞测序并分析其优势，就必然绕不开对“单细胞测序”“高通量技术”等概念的准确的把握。我们必须搞清楚，当一种技术前面带了“单细胞”（Single-cell）或“高通量”（High-throughput）的字眼时，它们分别代表了什么。单细胞，就是单个（仅一个）细胞的意思。针对单个细胞展开的分析统称为单细胞分析（Single-cellana.