
small RNA-seq
文章平均质量分 91
爱基百客
这个作者很懒,什么都没留下…
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表观项目文章速递,平均IF=9.7
该研究通过组织学、生化和转录组学分析,研究了患者、HN小鼠和UA刺激的HK-2细胞中HN的功能、病理和分子变化。通过使用带有骨膜蛋白启动子的腺相关病毒(AAV)过表达LIMK1或LIMK2,研究发现在DKO小鼠中,肌成纤维细胞特异性的LIMK2过表达减弱了这些作用,而LIMK1则没有。14)-阳性多发性骨髓瘤中,II类FINs与博来霉素的组合治疗通过抑制溶质载体家族7成员11的增加,降低了细胞谷胱甘肽水平,并诱导了细胞凋亡和铁死亡的发生,展示了在体外及异种移植模型中的协同抗肿瘤活性。的五个同源基因之一。原创 2024-09-25 11:08:48 · 1108 阅读 · 0 评论 -
New Phytol | 植物miRNA-转录因子-靶基因模块调控网络如何构建
GmMYC2在GmARF16-OE植株中的表达有较强的上调,表明大豆耐盐性可能受到GmARF16依赖的GmMYC2诱导的调控。然后,研究检测了GmARF16的编码区,并评估了它们的激活能力,由于G-A的替代,导致了不同的转录活性。随后,作者进行ChIP-qPCR、EMSA、LUC实验,结果支持了GmARF16可以通过直接与其启动子中的NNGACA基序结合来激活GmMYC2的解释,这与miR160a-GmARF16-GmMYC2模块在调节大豆耐盐胁迫中发挥作用的假说相一致。这类研究,都可以参考如下思路。原创 2024-07-05 11:55:45 · 1597 阅读 · 0 评论 -
干货分享 | 一文带您全方位认识MicroRNA
在多年的广泛研究中,根据小非编码RNA的大小和结构特征可以将其分类为:传统小RNA、结构小RNA和衍生小RNA(也称为非规范小RNA)[1],这些小RNA可以通过不同的机制参与各种生物过程,例如传统小RNA包括microRNA(miRNA)、piwi相互作用RNA(piRNA)和小干扰RNA(siRNA),他们可以与Argonaute蛋白(Ago蛋白)结合形成沉默复合体,进而切割或阻止靶向mRNA的翻译,或者介导染色质上表观遗传的改变,以达到沉默基因表达的目的[2];原创 2024-07-03 11:48:17 · 2215 阅读 · 0 评论 -
技术贴 | RNA甲基化修饰m6A的检测——MeRIP-seq
目前在细胞RNA中已经识别到了超过100种化学修饰,其中RNA甲基化修饰在生命活动中有着非常重要的作用(Xu et al 2020)。RNA甲基化是指在甲基转移酶的催化下,在RNA分子上的某一个原子上添加一个甲基基团(CH3)。RNA甲基化修饰类型有很多,比如:m6A RNA甲基化﹑m5C RNA甲基化﹑m1A RNA甲基化、m7G RNA甲基化等(Oerum et al 2021)(图1)。图1 不同类型RNA的转录后修饰(Oerum et al 2021)原创 2024-06-27 14:38:55 · 3245 阅读 · 0 评论 -
New Phytol & Small RNA-seq和ChIP-seq联合分析助力揭示稻曲菌抑制水稻免疫的新机制
作者利用Small RNA-seq、ChIP-seq、Y2H 、Western blotting、Co-IP和BiFC技术,从表观遗传水平揭示了稻曲菌利用效应蛋白操纵水稻组蛋白去乙酰化抑制寄主免疫的新机制。原创 2022-11-24 15:19:16 · 509 阅读 · 0 评论