更智能的蒙特卡罗方法
在传统的蒙特卡罗(Monte Carlo,MC)方法中,所有分子以相等的概率在随机选择的方向上移动,这种方式可能并非最高效的。下面将介绍一些更智能的蒙特卡罗方法,以提高模拟的效率和准确性。
1. 热力学积分与自由能计算
热力学积分是计算自由能差的一种准确途径,但可能需要大量的模拟来覆盖积分范围。为了避免这个问题,可以在积分范围内的适当温度下进行模拟,以实现高斯 - 勒让德求积,而无需插值。此外,找到感兴趣状态与参考状态之间的可逆路径也是一个挑战。
2. 更智能的蒙特卡罗方法核心
传统 MC 方法中分子移动的方式可能不是最优的,我们可以尝试对某些分子进行更频繁的移动,或者将移动偏向于首选方向。这种优先采样可以通过扩展 Metropolis 解来实现,其形式如下:
[
\begin{cases}
\pi_{mn} = \alpha_{mn}, & \alpha_{nm}\rho_n \geq \alpha_{mn}\rho_m, \quad m \neq n \
\pi_{mn} = \alpha_{mn}\frac{\alpha_{nm}\rho_n}{\alpha_{mn}\rho_m}, & \alpha_{nm}\rho_n < \alpha_{mn}\rho_m, \quad m \neq n \
\pi_{mm} = 1 - \sum_{n\neq m}\pi_{mn}
\end{cases}
]
其中,(\pi_{mn}) 是从状态 (m) 到状态 (n) 的一步转移概率。即使 (\alpha_{mn} \neq \alph
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