用各种分子生物法分析婴幼儿肠道微生物
- 中文标题:用各种分子生物法分析婴幼儿肠道微生物
- 日文标题:各種分子生物学的手法による乳幼児腸内細菌叢の解析
- 作者信息:中山二郎 (九州大学教授)
- 通信作者:園元謙二
- 通信地址:九州大学大学院农学研究院生物机能科学部门
背景和目的
许多研究表明益生菌可以改善或预防过敏性疾病。然而,在没有益生菌干预的情况下,研究过敏人群和非过敏人群细菌组成差异的研究并不多。在日本,有10%到20%的人口有过敏疾病。比如,食物过敏,在出生后的两年内发生食物过敏,哮喘以及特应性皮炎等。有相当多的证据表明,早期肠道菌群的发育对免疫系统的发育有很大的影响。然而,由于生活方式或遗传因素也会影响过敏的发展,因此需要进行大规模的流行病学调查,才能准确了解过敏与肠道菌群之间的关系。要实现这一目标,就必须要建立粪便微生物组成的高通量分析体系。在本报告中,作者比较了各种功能分子在流行病学分析中的适用性。
方法和结果
- 基因库的随机测序
采用一套通用引物PCR法从粪便样品中提取微生物组的总DNA,并扩增16S rRNA基因片段。将扩增产物克隆到大肠杆菌中来构建16S rRNA库。对多个克隆进行随机测序,并对数据库进同源性搜索