
代谢组
Deepgener
-Microbial Research -1.分享国内外top期刊的关于宏基因组,代谢组,转录组及其他组学等多组学文献的详细解读; 2.提供在宏基因组研究过程中软件安装技巧说明,生信统计方法及步骤分享;3.其它详见公众号推送
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nature | 吲哚乙酸脱羧酶可催化粪臭素的形成
标题:吲哚乙酸脱羧酶是一种甘氨酰自由基酶,催化恶臭粪臭素的形成文章截图文献导读厌氧细菌发酵芳香族氨基酸产生各式多样的代谢产物,并且保留了其稳定的芳香环结构(图1)。 由生活在人/动物肠道中的厌氧细菌产生,这些化合物可在宿主血液中积累,达到亚毫摩尔的浓度会具有全局生理或病理效应。 因此,详细了解这些发酵途径及其产品对人类健康至关重要。 许多发酵细菌能够分别降解芳香族氨基酸酪氨酸(Tyro...原创 2019-01-01 18:47:14 · 2844 阅读 · 0 评论 -
一个基于宏基因组或扩增子序列预测代谢组的工具 - melonnpan
一个基于宏基因组或扩增子序列预测代谢组的工具 - Melonnpan摘要菌群代谢组学,特别是在人类肠道中的代谢组学,开始提供一条新的途径来鉴定疾病中的功能和破坏的生态。然而,这些数据的成本很高,很难大规模获得,而扩增子或鸟枪法宏基因组测序数据对于成千上万的人群来说是现成的。在这里,描述了一个计算方法,以预测新的微生物群落中潜在的不可观察的代谢产物,给予一个模型上训练的配对代谢组和宏基因组。还...原创 2019-08-26 10:53:58 · 2242 阅读 · 0 评论