deepgener的博客

宏基因组数据分析专题之展望与数据质控导读宏基因组测序（Metagenomics Sequencing）是以特定环境下的微生物群落作为研究对象，对该样品中所包含的全部微生物总的DNA进行测序从而使人类可以研究微生物种群结构、物种分类，系统进化，基因功能活性、微生物之间以及微生物与环境之间的互作关系。因此，一定程度上来说，宏基因组测序摆脱了微生物分离纯培养的束缚，为环境微生物群落的研究提供了...

Microbiome | 宏基因组测序中减少样品中真核宿主的DNA污染文献导读与16S rRNA测序相比，使用鸟枪法宏基因组测序不仅可以更加深入地了解样本中微生物的分类和功能，也可以避免PCR扩增带来的偏差。然而，对于来源于真核宿主的样本来说，宿主DNA的污染不可避免。因此，使用鸟枪法进行微生物宏基因组测序时，测序深度往往会受到很大影响。如果能在测序之前去除样本中的宿主DNA，使用鸟枪法对...

基于全球人类肠道微生物组的细菌胆盐水解酶 (BSH) 基因的分类特征和种群模式文献导读BA （胆汁酸）由肝细胞中的胆固醇合成，之后进一步与氨基酸甘氨酸或牛磺酸结合形成胆盐并转移至肠道。此外，去结合的胆汁酸充当信号分子促进GLP-1的分泌，激活多种受体和影响不同的代谢物过程导致各种疾病。鉴于肠道微生物群在胆汁酸代谢中的重要作用，且胆盐水解酶（BSH）在胆汁酸介导的信号通路中也发挥重要作用，如...

精神分裂症患者肠道微生物组调节小鼠谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环和精神分裂症相关行为.文献导读很多研究表明，MGB（菌群-肠-脑）轴的紊乱可能与 SCZ（精神分裂症）的发生有关。为了解决肠脑轴的发育与精神分裂症有关，本文采用16S rRNA的方法来比较 SCZ 患者和健康对照(HCs)的肠道微生物群落，以评估微生物微生态失调是否与精神分裂症发作或精神分裂症症状的严重程度有关。然后，将SCZ...