肺肠轴——看不见的Crosstalk

一个基于宏基因组或扩增子序列预测代谢组的工具 - melonnpan 一个基于宏基因组或扩增子序列预测代谢组的工具 - Melonnpan 摘要 菌群代谢组学,特别是在人类肠道中的代谢组学,开始提供一条新的途径来鉴定疾病中的功能和破坏的生态。然而,这些数据的成本很高,很难大规模获得,而扩增子或鸟枪法宏基因组测序数据对于成千上万的人群来说是现成的。在这里,描述了一个计算方法,以预测新的微生物群落中潜在的不可观察的代谢产物,给予一个模型上训练的配对代谢组和宏基因组。还... 阅读详情

肺肠轴——看不见的Crosstalk

文献导读

肠道菌群是指存在于宿主肠道内的微生物,它参与了宿主多种重要的生理作用,如影响机体的营养代谢、调节机体免疫系统的发育与成熟及抗菌作用,因此肠道菌群又被人称之为"被遗忘的器官"。随着科学技术的发展,人们逐渐意识到到肠道菌群与全身各个系统的疾病的发生发展都存在着密切的关联,从而提出一些像"肠脑轴","肠肝轴"和"肺肠轴"等名词。

背景介绍

肠道微生物组的功能

据统计,定植于人体肠道内数量约是人体细胞数量的10倍,种类多达1000多种,大大超过了人体的基因组数量。婴儿在出生后,其肠道内开始有来自于外界环境中的微生物定植,随着年龄的增长,儿童体内的肠道菌群逐渐与成年人相似,并达到相对稳定的状态。宿主携带的肠道菌群其在体内发挥以下3个方面的作用:1.参与多种物质的营养代谢。其能产生一系列的催化酶参与膳食纤维、复杂的碳水化合物等物质的代谢,从而促进肠道吸收短链脂肪酸(SCFA)。肠道菌群也能够合成一些机体所需的营养物质,如叶酸、核黄素等维生素,并参与胆汁酸和外源性物质代谢。2.肠道菌群参与机体的先天性免疫应答和适应性免疫应答的发育和调节。此外,其还能够调节或影响不同类型免疫细胞的成熟及功能。(3)肠道菌群能够抵抗外来病原菌的侵袭。肠道菌群紧紧地黏附于肠上皮细胞,形成天然独特的生物黏膜屏障,可有效防止病原菌的入侵,且其产生的某些代谢产物如丁酸等能够帮助修复受损肠上皮细胞。截至目前,诸多CNS文献已经报道了肠道菌群失调会对我们的身体产生许多不良反应,促进了人类许多慢性和急性疾病。那么肠道菌群究竟是通过什么样的形式和手段来影响宿主的呢?其中有一种方式就是通过我们今天的主题:肺肠轴来实现的。

肺的功能

肺是很多进行空气呼吸的动物的呼吸系统中重要的一个器官,大部分四足类动物、一些

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