解锁蛋白质结构的奥秘:LiP-MS 技术引领结构蛋白质组学与药物发现新革命

LiP-MS(有限酶解耦合质谱)是一种用于检测蛋白质结构变化的创新技术。简单来说,它通过有限地消化蛋白质来揭示其结构状态。具体过程是在温和条件下用广谱蛋白酶对生物样品中的蛋白质进行短暂酶解,那些结构松散或暴露在外的区域更容易被酶切断,生成特定的肽段;而结构紧密或被配体保护的区域则相对不易被切割。随后,利用质谱技术对酶解产生的肽段进行鉴定和定量。通过比较不同状态下(例如有/无药物作用、不同环境刺激等)产生的肽段种类和丰度变化,就可以推断出蛋白质的结构发生了哪些改变。这种方法巧妙地将蛋白质的结构信息转化为肽段的质谱信号,从而在复杂生物体系中“读出”蛋白质构象的变化。

传统上,研究蛋白质结构变化往往依赖于X射线晶体学、核磁共振(NMR)或冷冻电镜等结构生物学技术,以及差示扫描量热(DSC)、荧光光谱等稳定性分析方法。这些方法各有价值,但也存在局限:例如晶体学和电镜需要获得高质量的晶体或样品,NMR对大分子蛋白分辨率有限,而DSC等通常只能提供整体稳定性信息,无法定位具体结构区域。与之相比,LiP-MS具有独特优势:

  • 高通量与全局性:LiP-MS能够在全蛋白质组水平上同时检测成千上万种蛋白质的结构变化。这是传统方法难以实现的。通过一次实验,研究者就可以发现哪些蛋白的结构因条件改变而发生了显著变化,而不必针对每个蛋白逐一验证。
  • 无需预先纯化或标记:LiP-MS直接在复杂样品(如细胞裂解液、组织匀浆)中进行,无需对目
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