三代测序结构变异分析 - 单样本Germline SV calling和多样本SV Calling

适用于三代PacBio HiFi / ONT 长reads数据的结构变异分析。

1. sniffles2安装

sniffles2需要Python >= 3.10环境，因此用conda创建安装好3.10的环境。

sniffles2安装要求：

• Python >= 3.10
• pysam >= 0.21.0
• edlib >=1.3.9
• psutil>=5.9.4

# 创建conda环境
conda create -n py3.10 python=3.10

conda install sniffles=2.4