程序功能简介
通过对ClassifyCNV CNV注释工具进行封装,只输入染色体编号+CNV起始位置+CNV结束位置,即可对该区域进行注释,并对结果进行格式化输出,保留原结果主要信息,精简结果文件。
CNV注释软件可参考本人以下文章:
生信软件11 - 基于ACMG的CNV注释工具ClassifyCNV
python代码封装
import pandas as pd
import os
import argparse
# import configparser
# 配置文件,根据需求设置
# file_config = configparser.ConfigParser()
# file_config.read('/public/confi
该博客介绍了如何使用Python对ClassifyCNV工具进行封装,通过输入染色体编号和CNV的起始及结束位置,实现对CNV区域的高效注释,简化结果文件,保留关键信息。
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