2020.9.2丨遗传图谱产品类型

• 建库测序分析
  • 重测序遗传图谱
    • 分析流程
      • 流程图

        

    • 重测序图谱划bin原理
      • 概念
        • 把在所有个体中均没有发生 重组的SNP划分到一个区块中，然后以该区块作为一个标记进行图谱构建 分析，极大的简轻了分析的工作量。
      • 划bin过程
        • Step1：根据SNP分型，确定每个样品染色体区段的亲本来源；
        • Step2：当出现亲本来源改变，则改变发生的地方为重组断点，每条 染色体上断点之间为一个block；
        • Step3：将所有样品的染色体进行线性比较，以每个重组断点为界将 所有样品的染色体划分为若干个区域，每个区域即为bin。 
      • 特点
        • 所有个体在bin内均没有重组发生。
        • bin的长度在几十kb到1-2Mb，所以无论开发的SNP有多少，在一定的群 体规模下，上图的bin数目变化不大。
    • 测序方案及送样要求
      • 测序方案