15-有参转录组实战1-批量质控-fastp

 

#本教程部分参考B站15天入门生物信息教程，在开启以下教程前，请务必看看我前面两个教程，Linux系统上安装R语言（https://www.bilibili.com/read/cv24718269）和下载好转录组（https://www.bilibili.com/read/cv24719254）。

#1，我们对上次下载的转录组进行实战分析，首先进行质量控制，使用fastp软件。

conda list#查看目前已经安装的包

conda search fastp#查看版本

conda install fastp=0.23.2#建议装个偏旧的版本

fastp-h#检查是否安装成功，有东西出来就行

#2，对文件重命名，回看NCBI，SRR22954651- SRR22954653是野生型，另外3个就是过表达了。