转录组数据分析——数据质控

1 fastqc的常用参数

-o 设置输出目录 -t 线程，同时处理几个样本

2 脚本运行的三种方式

2.1 直接运行——霸占控制台

fastqc -t 6 -o ./ SRR*.fastq.gz

2.2 脚本后台运行：nohup &——适用于比较简单的命令

no hup：no hang up不挂起，退出终端不会影响程序的运行 &：后台运行 大于号：重定向，运行的过程写入日志文件中

2.3 命令写入sh脚本，使用nohup+&运行脚本 ——适用于比较长和复杂的命令

vim三种模式命令的复习： vim进入命令行模式（默认） i进入编辑模式 esc返回命令行模式 :进入末行模式 wq保存并退出