5、土壤光谱数据处理与预处理全解析

土壤光谱数据处理与预处理全解析

1. 土壤光谱数据处理概述

在土壤研究中，光谱数据的处理至关重要。光谱数据通常以通用且易读的格式存储，加载到R环境后，需要进行基本的数据清洗、可视化检查以及冗余信息过滤，之后将数据保存为便于后续分析的格式。

2. 数据导入

光谱数据常以 .csv 或 .txt 的表格形式保存。 .csv 格式中，每行单元格的值用逗号分隔，因其在保存和加载时无需指定分隔方式，所以更受青睐。而 .txt 是标准文本文件，对于光谱数据，需要用户指定值之间的分隔方式，常见的分隔符有逗号、分号或制表符。

以下是从 .csv 和 .txt 文件加载数据的示例代码：

require(soilspec)
# 添加.csv数据的路径
path <- system.file("extdata", "soilspec.csv", package = "soilspec")
# 读取.csv文件
soilspec <- read.csv(path)
# 显示前十个列名
names(soilspec)[1:10]

# 添加.txt数据的路径
path <- system.file("extdata", "soilspec.txt", package = "soilspec")
# 读取.txt文件，使用制表符分隔
soilspec <- read.delim(path,