下一代测序技术:从历史到应用
1. DNA测序的重要性与早期发展
生命的奥秘蕴含在DNA序列之中。1962年,詹姆斯·沃森、弗朗西斯·克里克和莫里斯·威尔金斯因发现脱氧核糖核酸(DNA)的结构及其在生物信息传递中的重要性,共同获得了诺贝尔生理学或医学奖。DNA通过腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)这四种碱基的排列来调控生命活动,这些碱基的线性序列构成了生命的“语言”,每三个碱基组成一个密码子,指定一种氨基酸。1968年,罗伯特·W·霍利、哈尔·戈宾德·科拉纳和马歇尔·W·尼伦伯格因破解遗传密码谜题而获得诺贝尔生理学或医学奖,人们由此了解到密码子集合如何指导蛋白质的合成。
自DNA结构和遗传密码被发现以来,解读DNA序列的意义一直是众多科学家探索生命奥秘的重要任务。而读取DNA序列是解读其意义的前提,因此,开发更先进的DNA测序工具成为了竞争激烈的领域。
2. 第一代DNA测序技术
在20世纪70年代,DNA测序技术迎来了第一次革命,主要有两种竞争方法:桑格测序法(Sanger sequencing method)和马克萨姆 - 吉尔伯特测序法(Maxam–Gilbert sequencing method)。随着时间的推移,桑格测序法及其改进版本越来越受欢迎,逐渐掩盖了其他方法,直到2005年左右,下一代测序(NGS)技术开始崛起。
1977年,桑格及其同事使用他们的测序方法成功对第一个基于DNA的基因组——φX174噬菌体进行了测序,该基因组约有5375个碱基对,这一发现标志着基因组学时代的开始。
最初的桑格测序法在1975年采用两阶段DNA合成反应:
- 第一阶段
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