读书笔记:《生物信息学与功能基因组学》第十章(第一部分)
标题:多序列比对的基本概念与应用
核心概念
- 多序列比对的重要性:在生物信息学中,多序列比对是理解蛋白质或基因家族成员特征的重要工具。通过比对,可以揭示序列间的同源性,从而预测结构、功能和进化关系。
- 序列家族:序列通常以家族形式存在,包括来自同一体内的相关基因(paralogs)、同一种群的变异体(polymorphic variants)或不同种群的基因(orthologs)。
多序列比对的定义
- 多序列比对涉及三个或更多蛋白质或核酸序列的对齐,其中相同或相似的氨基酸残基被排列在同一列上,假定这些残基在进化上是同源的,并且在三维结构中也占据相应的位置。
应用场景
- 功能预测:如果一个蛋白质与已知功能的蛋白质同源,可以预测它可能具有相似的功能。
- 数据库搜索结果分析:多序列比对可以更容易地显示保守残基和模体,