CPGAVAS2|叶绿体注释工具

最新推荐文章于 2025-11-12 09:51:57 发布
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#叶绿体

本文介绍了叶绿体注释工具CPGAVAS2的使用步骤。首先，从NCBI数据库中寻找最佳参考基因组，通过Nucleotide BLAST进行序列比对，下载高相似度的Genbank文件。然后，在注释网站上进行注释操作，填写相关信息并提交任务。等待10-20分钟后，完成注释并下载解压结果。这是一个适用于学习和交流的叶绿体注释指南。

嘀嘀嘀，今天小编给大家介绍的是叶绿体注释工具CPGAVAS2的使用方法，觉得有用的盆友可以收藏起来。

使用方法

01 从NCBI数据库中寻找最佳参考基因组

1、进入NCBI官网：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/；
在这里插入图片描述
2、进入页面后点击BLAST, 新页面出现后点击Nucleotide BLAST；
在这里插入图片描述在这里插入图片描述
3、在方框中输入序列的accession number或者提交序列文件后，点击左下角BLAST；
在这里插入图片描述

4、出现这个页面之后请耐心等待，你提交的序列越长速度越慢；
在这里插入图片描述

5、比对完成后出现下方页面，点击Evalue找到相似度最高的，点击相似度最高的结果对应的编号，下载对应的Genbank文件；

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