R语言绘制ROC曲线图

受试者工作特征曲线(ROC曲线)，最初作为一种分析方法在二战时用于评价雷达性能(鉴别敌方，友方以及噪音)，目前广泛应用于医学诊断、生物信息学、数据挖掘和机器学习等研究中。
ROC曲线可用于评价生物标记物(biomarker)的表现以及比较不同打分方法(scoring methods)。因此，ROC曲线是非常重要和常见的统计分析方法，下面我们就用两种方法绘制ROC曲线图吧~

part 1：pROC绘制ROC曲线

1.下载pROC包和ggplot2包

BiocManager::install("pROC")
BiocManager::install("ggplot2")

2.调用pROC包，调用ggplot2包以利用ggroc函数

library(pROC)
library(ggplot2)

3.建立曲线

data(aSAH)
rocobj1<-roc(aSAH$outcome,aSAH$s100b)
rocobj2<-roc(aSAH$outcome,aSAH$wfns)
rocobj3<-roc(aSAH$outcome,aSAH$ndka)

4.计算full AUC

auc(rocobj1)
auc(rocobj2)
auc(rocobj3)

5.绘制曲线

plot(rocobj1)