高通量测序
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biomooc
这个作者很懒,什么都没留下…
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APA | CD47 alternative polyadenylation
概括:原创 2025-12-23 19:30:29 · 143 阅读 · 0 评论 -
ggplot2 | GO barplot with gene list
GO barplot with gene list on it原创 2025-05-09 17:27:58 · 359 阅读 · 0 评论 -
TCGA 数据下载与生存分析 //todo
TCGA 数据下载与使用。原创 2025-04-26 16:10:46 · 785 阅读 · 0 评论 -
bedtools coverage 获取每个位置的测序深度
bedtools 获取bam中每个位置的测序深度原创 2025-04-23 22:07:38 · 886 阅读 · 0 评论 -
LOH 怎么进行深度标准化?
测序深度的标准化原创 2025-04-22 21:29:01 · 559 阅读 · 0 评论 -
异想天开 | 什么是一流的学者?
如果一个顶级科学家不能提出一个哲学层面的概念,似乎有有点low了。当然,提出概念也是有巨大风险的,如果该概念被证伪,那么提出该概念的学者也一块跌落神坛。现在NIH院长提出,癌症是因为衰老!原创 2024-12-24 11:13:34 · 228 阅读 · 0 评论 -
怎么用 metascape 做GO分析
新页面就是GO分析结果,可以查看是否又感兴趣的GO 条目,可以点击顶部的 All in one zip file 保存到本地;等待进度条结束,大概1-3分钟,点击 出现的黄色按钮 Analysis Report Page,跳转到新页面。打开网页 https://metascape.org/gp/index.html#/main/step1。输入基因列表,一行一个基因,点确定;如果是人的基因,就再点确定。给下载好的zip文件名添加前缀,方便以后区分该zip文件是什么。原创 2024-12-15 15:29:58 · 1107 阅读 · 0 评论 -
R语言 | 峰峦图 / 山脊图
目的:为展示不同数据分布的差异。原创 2024-12-06 17:09:25 · 914 阅读 · 0 评论 -
单细胞 | label transfer with Seurat4(未知细胞映射到注释好的细胞图谱)
单细胞分析。原创 2023-05-12 22:56:27 · 3704 阅读 · 0 评论 -
统计学 | bootstrap 和 permutation test 的区别与联系?
如果我有两组数字,想做统计检验其差异。但是样本太小,不确定原始分布,只能做非参数检验。原创 2024-12-01 19:47:23 · 770 阅读 · 0 评论 -
TCGA 编码格式解读 | 怎么区分是不是肿瘤样品?
"-"分割符的第四位。原创 2024-11-29 21:30:36 · 1339 阅读 · 0 评论 -
IGV.js | 载入自己下载的gtf文件
IGV.js 的自定义原创 2024-07-24 20:43:57 · 622 阅读 · 0 评论 -
shell + Python3 | 解析理解 gencode gtf 基因组注释文件
怎么理解基因组注释文件(gtf)的格式与内容?原创 2024-07-20 19:45:58 · 1140 阅读 · 0 评论 -
生信工具能有多不靠谱?
生信环境越来越复杂,如何应对该挑战?原创 2024-03-21 11:32:46 · 653 阅读 · 0 评论 -
IGV.js 的完全本地化运行探索
IGV.js 的本地化运行探索。原创 2023-08-10 21:20:31 · 1369 阅读 · 9 评论 -
bam 格式 | 测序比对文件探究(STAR 比对 + pysam 包操作)
bam 保存的序列不一定和fastq中一致。正链则序列一致,负链是fq的反向互补序列。bam 的第二列Flag的意义怎么查?原创 2022-10-08 22:36:08 · 2255 阅读 · 0 评论
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