数学与统计
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曲线拟合，统计学，线性代数等
biomooc
这个作者很懒，什么都没留下…
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R拟合 | 一个分布能看到三个峰，怎么拟合出这三个正态分布的参数？ | 高斯混合模型 与 EM算法
高斯混合模型的拟合。原创 2025-07-24 14:29:14 · 342 阅读 · 0 评论 -
KNN 算法的实现 Annoy（Approximate Nearest Neighbors Oh Yeah）| 原理与实战
求3000个细胞在PC空间的20个最近邻，最快的实现方法是 annoy，Seurat 4也采用了该方法。Annoy 牺牲了精确度，提升了运算速度。通过多次构建，求共同最近的方法，能大致正确的求出高维空间中最近的k个邻居。原创 2024-12-25 22:31:11 · 503 阅读 · 0 评论 -
CCA R语言实现
CCA 分析原创 2024-06-03 13:15:14 · 873 阅读 · 1 评论 -
kmeans 最佳聚类个数 | 轮廓系数（越大越好）
轮廓系数越大，表示簇内实例之间紧凑，簇间距离大，这正是聚类的标准概念。目的：鸢尾花数据进行kmeans聚类，最佳聚类个数是多少？原创 2024-11-26 16:04:25 · 1273 阅读 · 0 评论 -
如何调试该死的Rcpp代码？如何复用Rcpp的so共享库文件？| 向量/矩阵运算
Rcpp中 mat.outerSize() 是稀疏矩阵的列数。原创 2024-10-20 20:52:02 · 880 阅读 · 0 评论 -
范数，L2范数标准化，及其用法和意义
L2范数（L2 norm），也称为欧几里德范数（Euclidean norm）或2-范数，是向量元素的平方和的平方根。它在数学和机器学习中经常被用作一种正则化项、距离度量或误差度量。对于一个n维向量x = [x1, x2, …原创 2024-10-17 16:38:13 · 1646 阅读 · 0 评论 -
R语言手工实现主成分分析 PCA | 奇异值分解(svd) 与PCA | PCA的疑问和解答
PCA的若干变种和代码实现：用svd代替特征值分解，用相关系数矩阵代替协方差矩阵。原创 2024-10-12 17:36:44 · 1223 阅读 · 0 评论 -
与PC1显著相关的基因 | p值计算
其中，统计量t符合自由度为 n-2 的t分布。原创 2024-08-30 20:08:23 · 650 阅读 · 0 评论 -
图论概念：Degree Centrality 和 Betweenness Centrality
Degree Centrality高的那些人一般都是大明星，有很大的知名度，比如微博中的姚晨。Closeness Centrality高的节点一般扮演的是八婆的角色（gossiper）。他们并不是明星，但是乐于在不同的人群之间传递消息。Heather就是Betweenness Centrality最高的节点，因为Ike和Jane到其它节点的路径都需要经过Heather。转载 2017-03-05 16:31:47 · 35575 阅读 · 0 评论 -
vst 算法R语言手工实现 | Seurat4 筛选高变基因的算法
vst算法的手工实现原创 2024-07-16 21:14:38 · 2002 阅读 · 0 评论 -
曲线拟合 | 二次B样条拟合曲线
曲线平滑化的方法，C1级平滑的B样条曲线。原创 2024-06-12 23:50:51 · 986 阅读 · 0 评论