A fuzzy Bruijn graph approach to long noisy reads assembly

针对第三代测序技术的挑战,提出一种创新方案,利用模糊布鲁金图高效处理长噪声读取,实现大基因组的快速组装。该方法通过允许更灵活的重叠长度,显著降低了计算资源需求,在人类基因组组装实验中展现出高效能。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

从第三代测序(TGS)中组装长噪声读取的一个挑战是降低其对计算资源的需求 提出了一种新的利用TGS数据高效组装大基因组的模糊布鲁金图

模糊Bruijn图De Bruijn图的关键区别在于,前者的重叠长度可以是千基和千基,用于长时间的噪声读取 实验中,在675.4 CPU中组装人类基因组 时间和结果的N50重叠的22.2百万

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