wangprince2017

请一定看这里：写下来只是为了记录一些自己的实践，当然如果能对你有所帮助那就更好了，欢迎大家和我交流三者区别三者区别差异分析流程:1 初始数据2 标准化(normalization)：DESeq、TMM等为什么要标准化？消除文库大小不同，测序深度对差异分析结果的影响怎样标准化？找到一个能反映文库大小的因子，利用这个因子对rawdata进行标准化3 根据模型检验求p value：泊松分布(poisson distribution)、负二项式分布(NB)等...

DESeq2详解先了解完整的分析流程和工具：http://blog.sina.com.cn/s/blog_9cf2d3640102x9kx.html这是一个系列文，包括：从标准的workflow开始，到更高级的数据操作和workflow个性化，最后是DESeq2的统计学原理以及常见的question解答本文介绍在差异表达分析之前的操作步骤，主要是DESeq2导入数据和预处理，DESeq2对导入不同数据类型兼容性很好。导入数据Why un-normalized counts? DESeq2

MRFSEQAs a fundamental tool for discovering genes involved in a disease or biological process, differential gene expression analysis plays an important role in genomics research.High throughput sequencing technologies, e.g., RNA-Seq, are increasingl...