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前段时间收集到的资源，可供阅读，对科研入门有一定帮助！

魅力化学发布日期：2020-05-18 作者： 来源： 点击：7化学是关于物质的组成、结构、性质与变化规律的科学，是人类认识和改造物质世界的主要方法和手段之一，也是最具创造性的科学之一。化学规律的发现及其应用展示了它的社会美。它的出现产生了强大的社会力量,给人类创造了巨大的物质财富,为人类自身带来了美好的生活。化学关系人类生存衣食住行和健康需求的方方面面、关乎国家经济发展、社会进步和国防建设的命脉，也是生命科学、材料科学、能源科学、航空航天、资源环境、食品、医药等学科的基础。化学的物质魅力世界是物

第一章 拿到博士学位需要多久一个比较实际的衡量标准就是你去参加会议的时候，有没有人在寻找你，想跟你讨论问题另外一种就是你的工作是否被同行所引用？第二章 博士生的终极目标等你毕业的时候，你想得到什么样的评价？我希望我能认可我的成长，包括英文的听说读写能力的提升，做talk的能力，发一篇以上的高质量论文，认可自己的研究成果，能有几个都还不错的工作选择。第一目标 成为最好：通过博士阶段的学习，你应该确立自己在某一领域的立足点和拥有者。你的研究工作要像一道光芒，普照到这一领域的每一个角落，能让每一.

论文写作心得 论文对于硕士，尤其博士，是必须的一种技能，也是一道难关。所谓 大道无形，小道可走。下面给出一些博士期间的写作心得，希望能有 所裨益。论文可以有三个境界：毕业、科研、贡献。 现在只说第一个，为了毕业。 这里的论文，可以指 EI 论文、SCI/E 论文。 我把论文分成三个阶段：读、写、改。 一、读 即：读哪些论文（对象），读论文的目的是什么（目标），怎么读（方法） 1.读什么论文。 读论文，需要读经典的专业基础论文、survey（概述）论文，

如何阅读文献 当我们对课题领域有一定的了解后，应该更快速地阅读更多文献，熟悉领域前沿。我的建议如下。 阅读量和时间 • 研究生每周研读 3-6 篇课题重点参考的原创文献（非综述）。使用不超过 3 小时阅读每篇文献。 • 分配每天的固定时间为文献阅读时间。养成习惯后，到了时间就容易开始阅读。 • 如果读完一遍不完全懂，放几天后再读一遍。敢于承认自己的知识断点，不要花很多时间抠读不懂的地方。 • 积极寻求帮助和交流，和研究组成员讨论文章中的亮点和自己的疑问。 阅读

Fastq文件大小和测序覆盖度初探王焕威聚道科技GeneDock2017-04-10(本文由GeneDock公司 Bioinformatics Engineer 王焕威撰写，转载请保留作者信息和原文链接)引 子在二代测序（NGS）领域中，Fastq文件大小和测序深度（即测了多少乘）是两个常用的概念，但不同人给出的Fastq文件大小与测序深度的比例可能并不一致，而且之间的关系也一直模糊不清。故，这篇博客就试图去探讨这两者的关系及其相关概念。基本概念1Fastq文件...

3Blue1Brown:“线性代数的本质”完整笔记離枝关注42018.02.07 02:23:09字数 5,434阅读 33,482一些感想我最早系统地学习线性代数是在大二时候，当时特意选修了学校物理系开设的4学分的线代，大概也就是比我们自己专业的线代多了一章向量空间的内容，其实最后上完发现，整个课程内容还是偏向于计算，对线性代数的几何直觉少有提起，对线性代数的实际运用更是鲜有涉及。同济的那本薄薄的如同九阴真经一般的教材，把线性代数讲的云里雾里，当时一个人在自习教室度过多少不眠之夜，一

CBC2020-day117 October 2020onCBC2020Xinyi Wang大会特邀报告报告者1：ZhangAidong（弗吉尼亚大学）报告题目：Meta Learning for Cancer Prediction来自维吉尼亚大学的ZhangAidong教授带来了为题“Meta Learning for Cancer Prediction”的精彩报告。报告主要针对癌症预测中部分癌症类别存在数据样本少的问题，如何使深度学习在少量癌症样本上也能表现高性能。Zhang教授...

TCGA数据库中含有的癌症名称，简写和中文名称Cohort 英文名称 中文名称 ACC Adrenocortical carcinoma 肾上腺皮质癌 BLCA Bladder Urothelial Carcinoma 膀胱尿路上皮癌 BRCA Breast invasive carcinoma 乳腺浸润癌 CESC Cervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarc

正则表达式：是对字符串操作的一种逻辑公式，就是用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合，组成一个“规则字符串”，这个“规则字符串”用来表达对字符串的一种过滤逻辑。^ 行首$ 行尾. 换行符之外的任意单个字符? 匹配之前项0次或者一次+ 匹配1次或者多次* 匹配0次或者多次{n} 匹配n次{n,} 匹配至少n次{m,n} 至少m,最多n[] 匹配任意一个[^] 排除字符| 或者sed：流编辑器，一般用来对文本进行增删改查...

http://www.scholat.com/wangchuang 学者网https://www.researchgate.net/profile/Wang_Chuang9研究之门https://www.labxing.com/profile/6269 labx

您的 16 位 ORCID 标识符为 0000-0003-1938-625X，您的完整 ORCID iD 号以及指向公开记录的链接为https://orcid.org/0000-0003-1938-625X（主邮箱地址：princewangchuang@163.com）.

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希望与骄傲（莫子英供稿）2020年8月29日晚7点半，湖南师范大学信息科学与工程学院张连明教授团队成员交流互动会在腾讯会议如期开展，本次互动会由信息科学与工程学院张老师提议，10级学生代表王家亮主持，共有往届、现届20多名学生参加，此次活动旨在建立师生之间常态化交流机制，围绕校内学术变化、组内课题、毕业生就业这几方面内容展开。互动会开始，张老师对近几年学校、学院变化进行了介绍，对组内课题进行了阐述，也分享了自己的日常生活。随后，学生代表王家亮对此次活动立意进行说明，张老师学生队伍不断壮大，.

Advantages of genome sequencing by long-read sequencer using SMRT technology in medical areaKazuma Nakano, Akino Shiroma, Makiko Shimoji, Hinako Tamotsu, Noriko Ashimine, Shun Ohki, Misuzu Shinzato, Maiko Minami, Tetsuhiro Nakanishi, Ku...

LDNFSGB: prediction of long non-coding rna and disease association using network feature similarity and gradient boostingLDNFSGB:利用网络特征相似度和梯度增强预测长链非编码RNA和疾病相关性Background: A large number of experimental studies show that the mutation and regulation of

认识SCI、EI、SSCI、IEEE、CSSCI、CSCD日期：2018-11-01 00:00:00 浏览量：39SCI SCI(科学引文索引)、EI(工程索引)、ISTP(科技会议录索引)是世界著名的三大科技文献检索系统，是国际公认的进行科学统计与科学评价的主要检索工具其中以SCI最为重要。 《科学引文索引》(Science Citation Index,SCI)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库，其覆盖生命科学、临床医学、物理化学、农业、...

《开源者说》08期：聊聊Java那些事儿发表于2015-06-10 18:23| 4388次阅读| 来源优快云| 28条评论| 作者陈秋歌 Java开源者说陈阳宫力许斌摘要：2015年5月23日，Java迎来了它的20岁生日。为此，我们邀请了北京GNOME用户组创办人陈阳、前美国Mozilla公司全球总裁宫力、清华大学计算机科学与技术系副教授许斌，一起聊聊他们与Java之间的那些事儿。 关于《开源者说》：《开源者说》由优快云推出，目的是为开源社区人士提供一个展示平台，推动国内开源社区..

4C:Creativity（创造力）、innovation（创新）、collaboration（团队）、critical thinking（培养辩证思维）、communication（重视交流能力）

AbstractNext-generation sequencing has become the most widely used sequencing technology in genomics research, but it has inherent drawbacks when dealing with high-GC content genomes. Recently, si...

5.3.4 Evaluation Results for PacBio Error Correction ToolsDue to the high error rate of PacBio reads, error correction outputs could have many uncorrected bases.Therefore, most PacBio error correc...

LoRDEC: a tool for correcting errors in long sequencing readsEric Rivals21st August 2015Abstract for keynote presentation at “German Conference in Bioinformatics”, Dortmund, GermanyAddress: La...

The Third Revolution in Sequencing Technology测序技术的第三次革命重点长读/第三代测序技术正在基因组学领域引发一场新的革命，因为它们提供了一种以前所未有的分辨率研究基因组、转录组和宏基因组的方法。SMRT和纳米孔测序首次允许直接研究不同类型的DNA碱基修饰。此外，纳米孔技术可以直接测序RNA并识别RNA碱基修饰。由于MinIO...

Genomes correction and assembling - Present methods and tools基因组校正和组装-现有的方法和工具摘要新一代测序(NGS)技术的迅速发展对基因组学研究领域产生了重大影响，使许多以前受技术成本限制的新物种测序项目得以实施。随着NGS的发展，需要对装配程序进行调整。新算法必须在合理的时间限制内处理大量的数据计算，处理能力和硬件也是一...

Haplotype-aware genotyping from noisy long reads单倍型识别的基因分型来自嘈杂的长读AbstractMotivationCurrent genotyping approaches for single nucleotide variations (SNVs) rely on short, relatively accurate reads...

An Efficient Approach based on Multi-sources Information to Predict CircRNA-disease Associations Using Deep Convoltional Neural Network基于多源信息的深度卷积神经网络预测CircRNA疾病关联的有效方法动机新兴证据表明，环状RNA（circRNA）在人类...

CDS和ncRNA的分物种数据库bioinfo2011关注2018.04.16 00:31:59字数 399阅读 128Ensembl FTP网站 (ftp://ftp.ensembl.org/pub/current_fasta) 收集了大多数物种的DNA, protein, CDS, ncRNA信息1. DNA不用说，就是基因组信息2. protein，就...

GWAS注：染色质开放性（chromatin accessibility）是指真核生物染色质DNA在核小体或转录因子等蛋白与其结合后，对其他蛋白能否再结合的开放程度。这一特性反映了染色质转录活跃程度，结合其他DNA修饰（如甲基化）信息，特定条件下的染色质开放性变化可以提供大量的基因表达调控信息，为各种蛋白结合新位点的发现指明方向。GWAS using SNP arrays ver...

The principle and application of the single-molecule real-time sequencing technology【题　名】单分子实时测序技术的原理与应用 【作　者】柳延虎 王璐 于黎 【机　构】云南大学 云南省生物资源保护与利用重点实验室 昆明650091 云南大学 云南省高校动物遗传多样性与进化重点实验室 昆明65009...

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