14、基于杂交的富集技术与二代测序在植物研究中的应用

基于杂交的富集技术与二代测序在植物研究中的应用

在当今的生物学研究中，基于杂交的富集技术与二代测序（NGS）相结合的方法正发挥着越来越重要的作用。本文将详细介绍商业可用的目标富集试剂盒、基于杂交的富集方法的技术考量、其在植物物种中的应用以及全基因组序列变异发现的主要生物信息学策略和工具。

商业可用的目标富集试剂盒

市面上有多种商业目标富集试剂盒可供选择，主要分为基于阵列杂交捕获和基于溶液杂交捕获两类。以下是一些常见试剂盒的重要特征：
| 捕获类型 | 试剂盒名称 | 诱饵类型 | 诱饵长度 | 目标大小 |
| — | — | — | — | — |
| 基于阵列杂交捕获 | NimbleGen Sequence Capture Array | DNA | 60 bp | 最多 30 Mb |
| 基于阵列杂交捕获 | Agilent Microarray | DNA | 60 bp | N.D. |
| 基于溶液杂交捕获 | NimbleGen SeqCap EZ | DNA | 55 - 105 bp | 最多 200 Mb |
| 基于溶液杂交捕获 | Agilent SureSelect | RNA | 114 - 126 bp | 从 1 kb 到 24 Mb |
| 基于溶液杂交捕获 | MYcroarray MYbait | RNA | 80 - 120 bp | 最多 200,000 个诱饵 |
| 基于溶液杂交捕获 | IonTorrent TargetSeq | DNA | 50 - 120 bp | 从 100 kb 到 10 Mb |

这些供应商都提供为感兴趣的物种设计定制试剂