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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_10肿瘤遗传学
十、肿瘤遗传学10.1 肿瘤概况10.2 肿瘤发生发展中的遗传学10.2.1 癌基因10.2.2 肿瘤抑制基因10.2.3 病毒感染与肿瘤发生10.2.4 表观遗传与肿瘤发生10.3 肿瘤治疗中的遗传学10.3.1 肿瘤常规治疗策略10.3.2 靶向治疗10.3.3 免疫治疗......
2022-08-12 17:05:50
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_09基因与演化
九、基因与演化9.1 进化理论与群体遗传学9.1.1 物种的形成9.1.2 遗传与进化的关系9.2 基因频率与哈代-温伯格平衡9.3 突变、自然选择、迁移9.3.1 突变与群体基因频率的改变9.3.2 选择与群体基因频率的改变9.3.3 迁移与群体基因频率的改变9.4 遗传漂变9.4.1 奠基者效应9.4.2 瓶颈效应...
2022-08-10 23:37:00
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_08遗传分析方法
八、遗传分析方法8.1 模式生物遗传分析策略与方法8.1.1 正向遗传学8.1.2 反向遗传学8.2 人类单基因性状的基因克隆8.2.1 功能克隆8.2.2 定位克隆8.3 人类复杂性状的易感基因筛选8.3.1 关联分析的原理8.3.2 关联分析的方法8.3.3 关联分析的应用...
2022-08-09 02:33:06
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_07基因表达调控
七、基因表达调控7.1 基因表达调控概论7.1.1 原核细胞基因表达调控的策略7.1.2 真核细胞基因表达调控的层次7.2 转录起始前复合物与基因表达调控7.2.1 RNA 聚合酶7.2.2 DNA 调控序列7.2.3 转录因子7.2.4 其他调控蛋白7.3 转录中与转录后水平的基因表达调控7.3.1 RNA 出核前的加工7.3.2 RNA 出核后的调控7.3.3 蛋白质的降解7.4 DNA 重组与组蛋白修饰7.4.1 DNA 重组与基因表达调控7.4.2 表观遗传的研究内容.
2022-08-08 18:14:55
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_06基因组
六、基因组6.1 基因组概论6.1.1 基因组概念、分类与性质6.1.2 基因组的结构与功能特点6.2 人类基因组计划6.3 人类(核)基因组的组成6.3.1 人类基因组概况6.3.2 人类基因组中的基因及基因相关序列6.3.3 人类基因组中的非编码 RNA6.3.4 人类基因组中的基因外 DNA6.4 基因组作图与测序方法6.4.1 基因组作图方法6.4.2 基因组测序策略.........
2022-08-02 02:30:53
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_05染色体畸变
五、染色体畸变5.1 染色体分析方法5.1.1 核型5.1.2 染色体显带5.1.3 人细胞的核型分析5.2 染色体重复与缺失5.2.1 染色体结构变异5.2.2 染色体缺失5.2.3 染色体重复5.3 染色体倒位5.3.1 倒位5.3.2 倒位的细胞学和遗传学效应5.3.3 平衡致死系5.4 染色体易位5.4.1 易位5.4.2 易位的细胞学与遗传学效应5.4.3 其他染色体结构变异5.5 染色体的数目变异——单倍体与多倍体5.5.1 染色体数目变异5.5.2 单倍体
2022-07-31 22:57:42
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_04连锁与交换
四、连锁与交换4.1 连锁交换4.1.1 连锁与交换的概念4.1.2 连锁现象的发现4.1.3 三点测交4.2 真菌的连锁分析4.2.1 四分子分析4.2.2 着丝粒作图4.2.3 两个基因的连锁作图4.3 遗传标记与遗传图谱4.3.1 遗传标记4.3.2 基因定位...
2022-07-30 15:22:37
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_03基因与基因突变
三、基因1. 基因的概念1.1 三位一体的基因概念1.2 三位一体的基因概念的修正2. 基因的基本属性2.1 基因是可调控的2.2 基因是可割裂的2.3 基因是可移动的3. 基因突变4. 基因分型
2022-07-28 16:25:09
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_02非孟德尔遗传+数量性状遗传
二、非孟德尔遗传1. 两种非孟德尔遗传1.1 核外遗传1.2 核质互作2. 数量性状遗传2.1 数量性状及其特征2.2 数量性状的统计分析方法2.3 数量性状的遗传特点2.4 遗传率的估算2.5 近交与近交系数
2022-07-23 15:00:22
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原创 【听课笔记】复旦大学遗传学_01孟德尔遗传
4. 等位基因间的相互作用4.1 完全显性4.2 不完全显性4.3 共显性4.4 镶嵌显性4.5 致死等位基因4.6 多效性基因5. 非等位基因间的相互作用5.1 互补基因5.2 上位效应5.3 修饰基因6. 复等位基因6.1 复等位基因概述6.2 ABO 血型决定基因6.3 ABO 血型决定基因的互作基因7. 表现度和外显率7.1 表现度7.2 外显率7.3 可变表现度和不完全外显的产生机制......
2022-07-20 16:20:16
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原创 【实验技术笔记】细胞表型检测之细胞粘附(细胞粘附实验) + 细胞侵袭(transwell实验)
细胞表型检测之细胞粘附(细胞粘附实验) + 细胞侵袭(transwell实验)
2022-06-25 17:24:37
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原创 【实验技术笔记】细胞表型检测之细胞迁移(细胞划痕实验 + transwell实验)
细胞表型检测之细胞迁移(细胞划痕实验 + transwell实验)
2022-06-25 14:16:29
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原创 【实验技术笔记】细胞表型检测之细胞凋亡(Hoechst染色 + PI染色 + TUNEL 染色 + Annexin V-PI 双染)
细胞表型检测之细胞凋亡(Hoechst染色 + PI染色 + TUNEL 染色 + Annexin V-PI 双染)
2022-06-24 14:02:33
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原创 【实验技术笔记】细胞表型检测之细胞增殖(CCK-8法 + BrdU掺入法 + 平板克隆)
1. 细胞增殖的定义2. 检测细胞数量:CCK-8 法3. 检测细胞增殖:BrdU 掺入法4. 检测细胞增殖:平板克隆
2022-06-22 23:23:23
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原创 【实验技术笔记】miRNA靶序列寻找及miRNA检测
1. microRNA 的基本知识2. miRNA 的基本操作2.1 miRNA 靶序列寻找2.2.1 TargetScan2.1.2 miRBase2.2 miRNA qPCR 检测2.2.1 引物设计2.2.2 反转录
2022-06-21 14:00:56
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原创 【实验技术笔记】基因沉默:siRNA/shRNA
1. siRNA/shRNA 的 RNAi 操作流程2. siRNA 设计2.1 设计途径2.2 预设计的 siRNA 库2.3 使用在线软件设计 siRNA3. 构建 shRNA 重组载体
2022-06-21 13:42:34
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原创 【实验技术笔记】融合基因 + 长片段基因 + 突变基因 表达载体构建
1、融合基因表达1.1 pCDH 和 pEGFP-C1、 pEGFP-N1 载体对比1.2 构建融合基因表达载体2. 构建长片段基因表达载体2.1 PCR 引物设计2.2 PCR(2 轮)3. 构建突变基因表达载体3.1 PCR 引物设计3.2 PCR
2022-06-20 20:20:46
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原创 【影像组学】从特征筛选到分类建模全流程实践及作图
1. 数据准备2. 特征权重图3. 特征相关性热度图 heatmap4. LASSO 模型中 Lambda 选值图5. 特征系数随 Lambda 变化曲线6. 随机森林分类器7. ROC 曲线8. 精确度(Precision),敏感度(Sensitivity),特异度(Specificity)等输出......
2022-06-19 20:40:43
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原创 【实验技术笔记】利用重组载体做基因过表达(pCDH载体)
1. 构建基因过表达载体1.1 设计 PCR 引物1.2 PCR 扩增目的基因1.3 酶切载体和 PCR 产物1.4 电泳并回收酶切产物1.5 连接1.6 转化1.7 挑选阳性克隆并鉴定2. 转染3. 检测过表达效果附表:常用酶切位点保护碱基............
2022-06-19 16:27:38
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原创 【影像组学】windows系统安装pyradiomics包的问题
pyradiomics 包的 官方文档 提示,只适用于 python 3.5, 3.6 or 3.7(windows系统),因此需要先确认安装的python版本。cmd 中输入 python 即可查看。python 版本降级方法一:打开 Anaconda Navigatior 按下图设置。python 版本降级方法二:在anaconda prompt中输入 conda create -n downgrade python=3.7 anaconda安装 pyradiomics 包:cmd 中输入..
2022-06-17 00:35:13
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原创 【影像组学】影像组学特征筛选和降维(T检验+LASSO+PCA)
导入数据t 检验特征筛选t 检验后数据处理LASSO 特征筛选4. 特征降维:主成分分析法 (PCA)主成分分析,PCA = Principle component analysis矩阵乘法◆ 一个 m 行 n 列的矩阵,与一个 n 行 r 列的矩阵相乘(前面的矩阵列数必须与后面的矩阵行数相等,否则不能相乘),将得到一个 m 行 r 列的矩阵: Dm×n × Tn×r = Pm×r◆ 在影像组学中, 对应病例数, 对应原始提取出的特征数,主成分分析法就是 以一个合
2022-06-16 15:34:11
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原创 【实验技术笔记】RNA 抽提 + 反转录PCR + PCR引物设计 + RT-qPCR
分子生物学实验技术笔记 PCR引物设计 + RNA 抽提 + 反转录PCR + RT-qPCR
2022-06-15 22:41:57
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原创 【实验技术笔记】Western Blotting 实验操作要点及数据分析
Western Blotting 实验操作要点及数据分析(Gel-Pro Analyzer)
2022-06-15 22:31:28
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原创 【学习笔记】山东大学生物信息学-07 数据挖掘(WEKA)
7.1 数据库系统7.2 机器学习7.3 WEKA7.3.1 ARFF 文件的格式7.3.2 ARFF 属性类型与格式转换7.3.2 数据准备:Explorer 界面介绍7.3.3 数据预处理7.3.4 执行挖掘任务
2022-06-13 14:50:04
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原创 【学习笔记】山东大学生物信息学-05 高通量测序技术介绍 + 06 统计基础与序列算法(原理)
05 高通量测序技术介绍 + 06 统计基础与序列算法
2022-06-12 01:27:57
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原创 3款简单实用的在线PCR引物设计软件
1. NCBI 的 Primer-Blast;2. Primer3 Plus;3. PrimerBank
2022-06-11 16:48:22
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分子生物学 图像处理软件 ImageJ FIJI版(window 64位)
2022-06-21
分子生物学 序列比对 引物设计软件 DNAMAN 9 英文注册版
2022-06-13
MRIcroGL 软件格式转换、勾画ROI
2022-06-13
3D Slicer 5.0.2 安装包(用于影像组学特征提取等)
2022-06-13
空空如也
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