高通量筛选药物发现中的信息管理与交互
1. 引言
在治疗药物发现领域,近年来科学技术取得了显著进展,如人类基因组测序、工业机器人、组合化学和高通量筛选(HTS)等。这些因素为药物发现带来了更多的靶点和先导化合物。
药物发现是一个复杂的多阶段过程,通常包括靶点识别、靶点验证、高通量筛选、先导优化和临床开发等阶段,具体流程如下:
- 靶点识别 :通过筛选基因数据库,利用同源性、共定位或其他标准来确定潜在的靶点。
- 靶点验证 :使用分子生物学技术(如基因敲除)和计算方法(如表达分析和途径阐明)来验证靶点。
- 高通量筛选 :对大量小分子进行筛选,以确定与靶点相互作用的“命中物”。
- 先导优化 :对命中物进行进一步分析和优化,以确定最适合进行临床试验的分子。
- 临床开发和生产 :对筛选出的分子进行临床试验和生产。
1.1 高通量筛选的优势与挑战
高通量筛选是一种在学术和制药领域广泛应用的技术,它通过微型化生化测定,使研究人员能够同时测试大量化合物对目标分子的结合活性或生物活性。这种技术不仅显著降低了先导发现的时间和成本,还能精细探索配体结构空间。
然而,高通量筛选会产生大量数据,这给数据的存储、交互和挖掘带来了巨大挑战。信息管理系统需要解决以下关键问题:
1. 开发高效的数据处理和分析技术。
2. 提供以流程和信息为中心的信息视图。
3. 处理信息的异质性,包括物理异质性(
高通量筛选数据管理与交互
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