基因 - 环境/基因 - 药物相互作用及全基因组关联研究解析
1. 基因 - 环境/基因 - 药物相互作用
基因 - 环境相互作用在许多孟德尔疾病中有着显著影响,环境条件会影响基因对疾病的作用,如苯丙酮尿症(PKU)与饮食的关系。在复杂疾病中,基因 - 环境相互作用作为效应修饰因子起着重要作用,例如基因与吸烟的相互作用会影响肺癌、哮喘和慢性阻塞性肺疾病(COPD)的发病风险。基因 - 环境相互作用变量范围广泛,甚至可以包含与疾病表型无直接生物学联系的环境评估变量。像国际多中心多动症遗传学(IMAGE)项目,招募了 960 名多动症儿童及其父母,研究多动症候选基因与社会经济地位(SES)之间可能存在的相互作用。研究发现,对于常见的纯合和杂合基因型,SES 对症状评分无影响,但对于罕见的纯合基因型,SES 对症状评分有显著影响。
基因 - 药物相互作用是基因 - 环境相互作用的特殊情况。如今,许多临床试验会收集患者的 DNA 样本,以确定患者对治疗的反应是否取决于其基因特征。基因 - 药物相互作用有助于识别不同基因型的患者亚组,这些亚组对治疗的反应可能不同,同时也能预测患者可能出现的不同严重程度的副作用。目前,人们正在努力利用基因型信息来提高药物的安全性和有效性。
在关联研究中,基因 - 环境相互作用的分析是研究重点。在基于人群的研究中,可通过在回归模型中加入相互作用项,将基因 - 环境相互作用直接整合到关联分析中,回归模型如下:
[g(E(Y)) = β_0 + β_1 × X + β_2 × E + β_3 × X × E]
其中,(Y) 表示感兴趣的表型,(X) 是编码标记分数,(E) 是环境暴露变量,(g) 是根据表型特征类型选择的链接函数,(β_1) 对
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