DGIdb：解锁“基因-药物互作”的精准医疗钥匙

最新推荐文章于 2026-01-01 22:38:21 发布

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#数据库 #谱度众合

在海量的基因与、药物的海量数据中，如何精准定位关键靶点和候选药物？无论是临床疑难病例的个体化治疗，还是基础研究中的靶点筛选，高效且精准的数据解读都是核心挑战。

DGIdb数据库作为全球权威的基因-药物互作资源库，为这些问题提供了坚实的数据基础。，而我们的定制化分析服务则将其转化为直接可用的临床与科研洞见，助力您的研究与实践！。

Part 1：认识DGIdb——基因-药物互作的“黄金数据库”

1.1 它是什么？

DGIdb（Drug-Gene Interaction Database）是全球领先的基因-药物互作数据库，它允许用户搜索靶向特定基因的药物，涵盖美国食品及药物管理局（FDA）批准的药物、实验药物以及在研药物，并提供适应症、靶基因和相互作用类型等详细信息。DGIdb整合了30+权威数据源（如DrugBank、, PharmGKB、, ChEMBL、, Drug Target Commons），覆盖：

1万+基因
2万+药物
7万+互作关系

官方网址：https://dgidb.org/

1.2 它能解决什么问题？
DGIdb的核心价值在于为研究人员和临床医生提供以下支持：

快速筛选基因的已知药物及作用关系：帮助您迅速锁定与特定基因相关的药物及其作用机制。

快速筛选药物的潜在新靶点：为老药新用提供可能的靶点方向。

判断可药用基因类别：助力识别具有药物开发潜力的基因。

Part 2：DGIdb在文献中的“高光时刻”

文献1：《Prognostic tools and candidate drugs based on plasma proteomics of patients with severe COVID-19 complications》

发表杂志：Nature communications（；双一区，IF=14.7）
研究亮点：研究人员基于重症与轻中症新冠患者血浆中上调的蛋白质，通过DGIdb数据库筛选与这些蛋白相互作用的FDA批准药物。他们发现215种FDA批准的药物可作用于74种蛋白质，并依据药物类别进行分组。研究还推导出一些药物组合，如利巴韦林与英夫利昔单抗或依那西普的组合，为新冠重症患者的药物治疗提供了重要参考。
原文链接：https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8854716/pdf/41467_2022_Article_28639.pdf

图中展示了单靶药物及多靶药物与蛋白之间的互作关系

部分文中表述

文献2：《Proteomic characterization of epithelial ovarian cancer delineates molecular signatures and therapeutic targets in distinct histological subtypes》

发表杂志：Nature communications（，双一区，IF=14.7）
研究亮点：研究人员在解析上皮性卵巢癌（EOC）信号通路紊乱时，利用DGIdb数据库筛选出已批准的药物靶蛋白，并将其在异常的KEGG通路中进行标注。通过分析这些通路中蛋白与EOC预后的关系，他们发现这些蛋白对应的药物靶点可能对未来临床治疗有益，为EOC治疗靶点的研究提供了重要依据。
原文链接：https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10684593/pdf/41467_2023_Article_43282.pdf

*图中展示了KEGG通路中的异常蛋白，药物靶点以绿色符号标注

文中表述
文献3：《Integrating human brain proteomic data with genome-wide association study findings identifies novel brain proteins in substance use traits》

发表杂志：Neuropsychopharmacology（，双一区，IF=7.5）
研究亮点：研究人员通过DGIdb数据库分析了与物质使用特质（SUTs）相关的风险基因与处方药物之间的相互作用。他们查询了27个SUT风险基因，发现了33种药物-基因相互作用，涉及5个基因（SRR、PRKCD、PLD1、NT5C2和NQO1）。研究优先考虑了SRR和NQO1作为潜在的药物靶点，特别是SRR与维生素B6的代谢活性形式（PLP）的相互作用，提示其在吸烟相关机制中的潜在作用。
原文链接：https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9630289/pdf/41386_2022_Article_1406.pdf

*图中展示了药物-基因相互作用，每个基因都与药物类别相连，每个线的宽度由每个类别中已知与每个基因相互作用的药物数量决定。

文中表述

Part 3：在我们的产品中，DGIdb如何“大展身手”？

目前DGIdb已加入感染性疾病研究一站式解决方案（请插入产品主页文章链接）中，我们将为您提供以下服务：

基于关键蛋白列表查找基因-药物网络：生成相互作用网络图（图A），直观展示蛋白与药物的关联；
靶点细分类：从多个权威数据库（AnimalTFDB4/PhosphoSitePlus/TCDB/TTD/CellChatDB）中检索关键蛋白中的转录因子、激酶、离子通道蛋白、疾病靶点和受体蛋白（图B-E），直接定位功能模块；
多靶点药物排名：筛选Top5多靶点药物（图F），快速锁定广谱抑制剂。
我们还将提供详细的数据表格，涵盖蛋白-药物互作关系强度、药物批准状态、是否为免疫药物和抗肿瘤药物等信息。