8、药物作用模式与桉树渗透保护剂基因研究

药物作用模式与桉树渗透保护剂基因研究

1. 药物作用模式地图构建

在药物研究领域，有一种基于基因表达数据构建药物作用模式地图的方法。该方法以用150多种不同化合物处理5种不同人类细胞系所获得的基因表达数据为基础，结合了监督版本的富集分数和排名聚合方法来构建地图。

当k = 15时，在富集分数（ES）空间中对获得的树状图进行适当切割，能得到与监督标记非常接近的聚类结果，聚类的全局最大值为0.91。但如果在使用经典相关度量对测试集基因表达谱（GEPs）在所有探针域中获得的空间应用此过程，无法得到这样的结果。

最可靠的聚类（k = 15）组成显示，即使存在单例聚类，仍检测到了五类药物，其中两类的灵敏度分数达到100%，其他几类约为80%，且具有相同治疗应用或分子靶点子集的药物被归为一类。该方法避免了复杂的跨条件归一化程序，能提供经典相似性度量无法实现的地图。

2. 桉树转录组中渗透保护剂的计算机模拟评估

2.1 背景与目的

干旱和盐胁迫常相互关联，会对植物细胞造成如渗透和氧化应激等损害。植物为适应这些不利环境，会积累有机溶质（渗透保护剂）来保护蛋白质和膜。此前对草本植物应对非生物胁迫的机制有较多研究，但对木本植物的了解较少。桉树是干旱和半干旱地区的主要木本植物，其抗旱生理特征包括更强的渗透调节、组织弹性、较高的叶片含水量和抗干燥能力。

本研究旨在通过计算机模拟程序，在FORESTs数据库中寻找桉树渗透保护剂基因的直系同源物，评估其在FORESTs文库中的表达，并与公共数据库和文献数据中的序列进行比较。

2.2 方法步骤

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