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RSS订阅原创 个人科研AGI，需要一套Agent 调度系统：BoundedFreedom
科研使用 AI，真正需要的不是永远调用最强模型，也不是让尽可能多的 Agent 同时工作。简单任务少花；复杂任务再升级；机械工作交给轻量模型；科学结论交给独立审查；重要边界始终由人控制。让 Codex 的额度更耐用，也让科研结果更让人放心。
2026-08-24 10:22:01
388
原创 神经影像坐标系转换
在处理 NIfTI 格式的神经影像数据时，经常会遇到不同软件或流程对图像方向的要求不一致。例如，有些流程希望输入数据是 方向，有些流程则要求或默认使用 方向。本文记录如何将神经影像数据从 转换为 ，以及转换过程中需要注意的问题。在神经影像中， 和 都是描述图像空间方向的字符串。常见方向代码含义如下：例如：需要注意的是，RAS/LPI 不只是文件名里的标签，而是与 NIfTI 文件中的 affine、qform、sform 和数据矩阵排列方式有关。从 转到 通常有两种完全不同的操作：重新排列/翻
2026-06-15 12:18:05
197
原创 Codex ran out of room in the model‘s context window.
提示删掉历史，压缩上下文，控制codex clear都不行。找到了这个文件，看了一下就有。压缩上下文，然后就可以用了。手动删掉早期的历史信息。
2026-06-08 17:19:01
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3
原创 EPI 序列 （fMRI/d MRI）phase encoding字段对应关系
正确做法是先读取每个 NIfTI 的 orientation，再把 BIDS。用来描述 phase encoding 发生在哪一个。它们不是固定的解剖方向缩写，因此不能直接等同于。
2026-06-07 19:50:36
207
原创 R seesion aborted - R encounterd a fatal error. The session was terminated.
R-studio升级不完全带来的软件问题。=
2026-01-05 17:22:17
304
原创 VIP文章的问题
几日不上优快云，发现自己的大部分文章变成了仅VIP可读。自己的成长，很大程度上依赖计算机领域的开放性、活力。GNU的开放、开源分享精神，受到了极大的挑战。近来经济恶化，如何创收成为了主要的问题。从06年上大学到现在，已经快20年了。各种资源都能免费分享，可以方便讨论。至少，我把VIP可见的文章都去掉了。感觉我还是要贡献一点开源的力量，设为粉丝可见，不过分吧。
2025-11-18 11:21:50
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原创 Smart #5 Brabus使用45天（7500KM+）初步体验
在长途驾驶的过程中，Co-pilot确实有帮助，但又很智障。所以，只能叫辅助驾驶系统。
2025-07-30 16:11:03
511
原创 Torch 在Nvdia，Mac，以及CPU之间的跨平台兼容性问题及解决方案，以及antspyx 安装debugs， life span brain segmentation model安装配置
【代码】Torch 在Nvdia，Mac，以及CPU之间的跨平台兼容性问题及解决方案。
2025-06-05 09:17:40
384
原创 R --- Error in library(***) : there is no package called ‘***’ （服务器非root用户）
【代码】R --- Error in library(***) : there is no package called ‘***’ （服务器非root用户）
2025-03-26 14:55:19
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原创 NiChart 多模态神经影像（structural MRI，functional MRI，and diffusion MRI）处理和分析工具包安装
多模态神经影像处理和分析工具NiChart安装和部署
2024-12-26 15:41:17
975
原创 The top-level auxiliary file: sn-article.aux I found no \bibstyle command---
最后发现，原来是更新了操作系统，导致很老的MikTex不能工作，于是更新MikTex到最新的版本，然后就能正常工作。突然间，Latex的references全变成了？，查找了很多帖子，都没有能解决。
2024-12-04 17:38:12
234
原创 MR image smoothing or filtering 既 FWHM与sigma之间的换算关系 fslmaths -s参数
大量的文献中都使用FWHM 作为单位，描述对MR等数据的平滑（smoothing）或者滤波（filtering）过程。FWHM 通常是指full width at half maximum的缩写，然而，在当前不少的MR处理工具中，提供的参数是高斯滤波核中的sigma,i.e.σ。σ那么数据就会过平滑，造成错误。
2024-01-24 11:35:59
1831
原创 NAS使用的一些常见命令 ssh sftp 上传 下载 配置qBittorrent | ALL in one
如果要保留当前的文件信息，如（修改时间、访问时间等），在加上-p标志。将sftp服务器上文件夹下载到本地当前目录下。将sftp服务器上文件下载到本地当前目录下。将本机上文件夹上传到远程服务器上当前目录下。将本机上文件上传到远程服务器上当前目录下。等，本机操作，前缀为l。
2024-01-09 14:22:14
1603
原创 TeX capacity exceeded, sorry [main memory size=* ] TIKZ绘图内存太大，增加mem解决方案
usr/local/texlive/2023/texmf-dist/web2c 修改。D:\MiKTeX\miktex\config 修改。
2024-01-05 11:13:04
1637
2
原创 CMakeTmp/testCXXCompiler.cxx:4:21::/tmp/*** No space left on device
CMAKE 编译 No space left on device
2023-10-24 13:15:24
454
原创 transformconvert: [ERROR] invalid first line (expected “#Insight Transform File V1.0“)
仿射变换矩阵从ANTs格式转成MRtrix3格式
2023-09-01 11:22:34
238
原创 在Matlab中，扩展最大为12个可用的logic cores的方法；To terminate the existing session, use ‘delete(gcp(‘nocreate‘))
在matlab中默认是只能使用12个cores，然而有时候我们的Linux服务器cpu核心数可能远远大于12，默认使用parfor的话，只能开启12 logical cores，而如果应选择72个cores的话，就会报错，
2023-08-19 00:14:17
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原创 M1 Mac使用Mrivew 显示神经纤维
由于苹果🍎把GLSL geometry shaders 改成了Metal API，所以无法以默认的mrview神经纤维显示参数启动。要解决，首先要打开~/.mrtrix.conf。改成下面的参数：Lines。
2023-08-14 19:59:20
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原创 LLaMA 70B Mac部署使用，解决 wrong shape； expected 8192 x 8192 小bug
mac在关闭显示器的时候，总是会自动进入睡眠，这样在下载大模型的时候，网络一中断，就无法继续下载。通过显示器-显示器能耗设置-能耗（显示器关闭时，防止自动进入睡眠），就可以防止系统睡掉。
2023-08-01 16:06:09
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原创 纯小白安装和使用CodeWhisperer，解决Unable to connect to AWS错误
CodeWhisperer可以插入Pycharm、VS-codes等IDE工具，辅助写代码。由于对于AWS亚马逊的生态一无所知，看别人的安装视频时常一头雾水，不知所云。例如知乎给出的帖子，已经很详细了，https://zhuanlan.zhihu.com/p/632593176，但还是对里面的概念不了解，CodeWhisperer的功能也无法正常使用。
2023-07-12 15:28:58
3277
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原创 DIPY - Bundle-based Analysis，AFQ和BUAN，更新ing
大脑白质分析，神经纤维束分割，比较等，碎碎念，流水账记录。
2023-07-09 20:50:28
698
原创 MacBook M1 32G配置大语言模型
🍀 For MacOS with Arm-based M1/2 Chips，部署大语言模型，跳坑有心得。ImportError: cannot import name '_itree' from partially initialized module 'itree' mach-o file, but is an incompatible architecture (have (x86_64), need (arm64e))
2023-07-08 23:15:24
1857
原创 EPI distortion correction形变矫正, eddy, fieldmap等五种不同方法
diffusion/functional MRI data preprocessing
2023-05-01 20:22:15
4370
5
原创 安装 AFQ以及babyAFQ，24小时趟坑记录（SLURM集群部署坑已填-2023-5-9）
白质神经纤维束分割工具AFQ/babyAFQ趟坑,1）.dylib not found error;2）command not found error.
2023-04-30 14:23:31
1293
原创 Nvidia A100安装tensorflow 1.15.5
python，显卡，cuda版本造成tensorflow安装不成功的解决思路
2023-03-30 11:14:35
2492
10
原创 ssh:连接到主机bitbucket.org端口22:连接超时
ssh: connect to host bitbucket.org port 22: Connection timed outfatal: Could not read from remote repository.
2023-01-05 17:28:39
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原创 Nvidia A100-SXM4-80GB 上跑niftynet使用tensorflow1.15踩坑
A100-80G 上跑tensorflow 1.15的niftynet
2022-12-12 00:27:06
1077
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2019-07-31
OpenCV 3.20 + contrib
2017-05-26
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