R --- Error in library(***) : there is no package called ‘***’ （服务器非root用户）

步骤一：在自己目录下创建R包安装路径

mkdir -p ~/R_libs

步骤二：配置用户本地的R库路径

在家目录下，编辑（或新建）.Renviron文件：

vim ~/.Renviron

在文件内写入如下内容： R_LIBS_USER=~/R_libs，保存后退出。

步骤三：安装缺失的包（在终端）

在终端运行：

module add apps/R/4.3.2
module add compiler/gnu/8.3.0_fortran

R

进入R后，执行：

install.packages('mice', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lme4', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lmerTest', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('piecewiseSEM', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('openxlsx', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('dplyr', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('ggplot2', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('DiagrammeR', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('sjPlot', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')

步骤四：验证安装

退出R：

quit()