auto_star的博客

R-studio升级不完全带来的软件问题。=

在 FSL虚拟机 CentOS linux系统中安装ANFI包，期望Resample DTI和fMRI数据。首先，按照官方按照教程step-by-step安装软件，直到suma -update_env一步一切都正常。但suma回车之后报错(base) [fsluser@fsl ~]$ suma -update_envbash: suma: command not found...Similar command is: 'sum'这里报错的原因是漏掉了教程中，更新环境变量一步。这里稍稍吐槽一下自己

多模态神经影像处理和分析工具NiChart安装和部署

神经纤维束配准技术， 线性&非线性；plus RAS LPI影像空间，配准基础知识

仿射变换矩阵从ANTs格式转成MRtrix3格式

由于苹果🍎把GLSL geometry shaders 改成了Metal API，所以无法以默认的mrview神经纤维显示参数启动。要解决，首先要打开~/.mrtrix.conf。改成下面的参数：Lines。

大脑白质分析，神经纤维束分割，比较等，碎碎念，流水账记录。

定制FSL文件，获取对应文件路径的方法。

noddi包安装

入坑了tensorflow，使用图学习模型做无监督特征提取。主要是使用graph autoencoder（GAE） 提特征，然后做分类。因为已经有了经过预训练的网络，就想要使用预训练的网络权值做初始化，然后利用新的数据集重新训练网络。自己花了五天，踩了挺多莫名奇妙的坑，看到网上的教程很多，但是还没有一个是我这样的需求，就记录一下，分享下 踩坑经验。总结了一下，大概有这么三个命令十分关键，大部分的问题都来自这三个命令。 1. saver = tf.train.Saver() # tf.trainable

在使用matplotlib包画Networkx生成的networks时，会报 AttributeError: module 'matplotlib.cbook' has no attribute 'is_string_like' 这样的错误。不少的帖子都说将matplotlib版本降低，然而这样就无法使用3d的layout。pip install matplotlib==2.2.3.而实际上，这个问题是由于matplotlib的版本和Networkx不匹配而产生的。都使用最新的版本就没问题了。参考

FSL bug correction