R note for Bioinfo :选择调用的列是未定义的
出现的问题:
根据GPL号下载返回的对象,用Table命令处理时,
输入:Table(gpl号)[1:选取的行数,c(“ID”,”其他列属性”,。。。)]
出现报错:
Error in [.data.frame… undefined columns selected
解决问题的方案:
Table(gpl号)[1:选取的行数,c(“ID”,”其他列属性”,。。。)]
注意将这里的其他列属性与原数据库进行比对,看是否一致
将不一致的列属性进行修改成与原数据库的列字段一致后
报错消失,正确运行
解决问题的具体命令:
Table(gpl号)[1:10,c(“ID”,”GB_ACC”,”Gene Title”,”Gene Symbol”,”ENTREZ_GENE_ID”)]
本文介绍了解决在使用RnoteforBioinfo时遇到的列调用错误问题。当通过GPL号下载数据并尝试使用Table命令处理特定列时,可能会遇到未定义列的选择错误。文章详细介绍了如何检查并确保所选列名与数据集中的实际列名相匹配的方法。
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