dotplot中提到的概念:E-value.表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于S值的可能性。所以它的分值越低越好。
E值的计算:(某处公式为MEAN/SD,应该是不对的,说不通)
E=K*m*n*(e-lambda*S)
其中,K和lambda与数据库和算法有关,是个常量;m代表目标序列的长度,n代表数据库的大小,S就是前面提到的S值。
Dotplot中的E值解析
本文解释了dotplot中E值的概念及其计算方法。E值反映了在随机情况下,其他序列与目标序列相似度超过一定阈值的概率。文章还介绍了E值的计算公式,并解释了公式中各参数的意义。
dotplot中提到的概念:E-value.表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于S值的可能性。所以它的分值越低越好。
E值的计算:(某处公式为MEAN/SD,应该是不对的,说不通)
E=K*m*n*(e-lambda*S)
其中,K和lambda与数据库和算法有关,是个常量;m代表目标序列的长度,n代表数据库的大小,S就是前面提到的S值。
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