BLAST中的E值(E-value)

最新推荐文章于 2025-09-20 19:19:52 发布
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本文解释了dotplot中E值的概念及其计算方法。E值反映了在随机情况下，其他序列与目标序列相似度超过一定阈值的概率。文章还介绍了E值的计算公式，并解释了公式中各参数的意义。
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dotplot中提到的概念：E-value.表明在随机的情况下，其它序列与目标序列相似度要大于S值的可能性。所以它的分值越低越好。

E值的计算：（某处公式为MEAN/SD，应该是不对的，说不通）

E=K*m*n*(e-lambda*S)

其中，K和lambda与数据库和算法有关，是个常量；m代表目标序列的长度，n代表数据库的大小，S就是前面提到的S值。

引用：
http://blog.sciencenet.cn/blog-830496-676326.html

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