PyMOL渲染

原创 已于 2025-05-29 23:12:16 修改 · 3.1k 阅读 · 8 ·
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#机器学习 #神经网络 #python

于 2022-03-29 16:28:18 首次发布
本文介绍了如何使用PyMOL渲染小分子及其周围残基，包括将残基设为独立对象、显示为Sticks格式、标记氢键、调整标签大小和隐藏、增强小分子显示以及标记氨基酸等步骤，旨在帮助读者掌握分子结构的可视化呈现。

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1.找到小分子周围的残基

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2.将显示的残基新建为一个对象

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2.小分子单独设置为一个对象

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3.将残基显示为Sticks格式

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4.显示氢键：找到小分子对象

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5.氢键键长：找到自动生成的氢键对象

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6.修改标签大小

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7.隐藏标签：找到自动生成的氢键对象

在这里插入图片描述
手动显示键长：Wizard—measurment—依次选择两个原子

8.增强小分子的显示：小分子对象—S—as

在这里插入图片描述
下图为几种格式显示
在这里插入图片描述

9.标记氨基酸：选择相应残基对象

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拖动标签到相应位置：右下角点击Mouse mode ；然后按住Ctrl 选择相应的标签进行拖动

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10.渲染图片

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