NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据

玩水的张同学

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分类专栏：宏基因组文章标签： big data 数据库 html5

于 2021-09-30 21:42:22 首次发布

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/zx_zhang01/article/details/120561410

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这篇博客详细介绍了如何将16S rRNA测序数据上传至NCBI，包括登陆官网、选择序列类型、注册账号、填写提交信息、选择生物样品类型、填写样本属性、提交SRA元数据和上传文件的步骤。

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NCBI上传16S rRNA测序数据

上传16S rRNA测序数据，直接选16S rRNA就可以，然后弹出上传数据集的类型，选择SRA
在这里插入图片描述

选择SRA后，会弹出如下的一些提示信息，直接选择submit即可；
在这里插入图片描述

进入正式提交信息的页面；注意此处的“My submissions”选项，注册完账号后，仍需返回这里

选择右上角的登陆账号—>选择ORCID登陆/注册（已经申请过账号可以直接登陆，没有申请则需要注册依次填写个人信息，个人信息如实填写就可以）—>注册完，后返回本界面，找到 “My submissions”选择。
在这里插入图片描述

根据网页上方显示的顺序，依次填写

只需要对标注“*”，“ ** ”的填写即可。
其中"Sample Name"直接填写送样时的样品名称，日期最好一个样品名称配一个日期，之前填写的相同的日期，一直显示存在“Error”。其他选项直接按照下列模板填写即可。

这里除“Sample Name”，“Filename”自己填写之外，其余部分直接按照下列模板填写即可。注意：“Filename”命名需要填写上传文件名的全部名称（包括后缀名）。例如：上传文件名为：zzx.fastq,则“Filename”命名也需要写为：zzx.fastq，而不是zzx。
点击提交后显示不成功，可以再修改一下Filename选项，填到“Filename2”，多次点击"Continue",即可进入下一步