NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据

NCBI上传16S rRNA测序数据

1.登陆NCBI官网

NCBI官网链接

2.选择上传序列类型

上传16S rRNA测序数据，直接选16S rRNA就可以，然后弹出上传数据集的类型，选择SRA

3.注册NCBI账号

选择SRA后，会弹出如下的一些提示信息，直接选择submit即可；

3.1 进入提交信息页面

进入正式提交信息的页面；注意此处的“My submissions”选项，注册完账号后，仍需返回这里

3.2 注册NCBI账号

选择右上角的登陆账号—>选择ORCID登陆/注册（已经申请过账号可以直接登陆，没有申请则需要注册依次填写个人信息，个人信息如实填写就可以）—>注册完，后返回本界面，找到 “My submissions”选择。

4. 提交信息

4.1. 提交者信息完成

根据网页上方显示的顺序，依次填写

• 带星号为必填选项，填写完毕后直接点击"Continue"进入下一项
  

4.2. 基因序列信息

• 根据每个选项的要求如实填写就好(下图分别为中英文展示)
  
  
  注：发布日期即为自己上传的测序序列公开的时间，一般自上传日期起至三个月即可。

4.3. 项目信息

• 项目名称可以根据返回的测序文件命名(避免与之后上传命名重复)；项目描述只要写清楚就行(测序区间，样品类型，测序设备等）
  

4.4.生物样品类型

• 此处只需要选择生物样品类型即可
  
  活性污泥样品就直接选择“Metagenome or environmental”—>点击“Continue”进入下一步
  

4.5. 生物样本属性

• 只需要对标注“*”，“ ** ”的填写即可。
  其中"Sample Name"直接填写送样时的样品名称，日期最好一个样品名称配一个日期，之前填写的相同的日期，一直显示存在“Error”。其他选项直接按照下列模板填写即可。
  

4.6. SRA元数据

• 这里除“Sample Name”，“Filename”自己填写之外，其余部分直接按照下列模板填写即可。注意：“Filename”命名需要填写上传文件名的全部名称（包括后缀名）。例如：上传文件名为：zzx.fastq,则“Filename”命名也需要写为：zzx.fastq，而不是zzx。
• 点击提交后显示不成功，可以再修改一下Filename选项，填到“Filename2”，多次点击"Continue",即可进入下一步
  

4.7. Files提交

• 选择网页提交—>挨个上传原始数据文件夹中的combined_fq.rar里面单个数据文件（可以一次加入三四个文件，防止断网）—>Autofinish submission。等待数据上传完成。
  
  显示下列界面则表示传输完成，点击"Continue"进入下一步
  

4.8. Review and Submit

• 点击“Continue”后出现下列界面。则说明提交成功，等待几天后接收SRA号即可