逐步功能连接 stepwise functional connectivity 详解和代码实现

本文详细介绍了逐步功能连接分析,一种用于理解大脑系统如何结合在一起的方法。通过计算全脑网络的个体关联矩阵并应用FDR校正,得到二值化的无向图作为SFC分析的输入。SFC分析关注不同步长下的连接模式,以揭示种子区域与其他区域的多级连接。文中还引用了关于过度肥胖和自闭症中SFC变化的研究,并提供了binarize_conn.m、findwalks.m和compute_sfc.m等代码示例。

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逐步功能连接分析

虽然功能连接和静息态 MRI 研究的很大一部分集中在大脑网络的分离或隔离上,但在这里我们关注一个互补且本质上不同的问题,这对网络神经科学来说是一个新的挑战:大脑系统如何结合在一起 ? 我们使用 SFC 分析来绘制不同步长(或“链接步长”)距离下大脑种子区域的连接模式。 从某种意义上说,使用跨神经元示踪剂研究大脑目标的多突触/多步回路的束追踪技术领域,允许整个功能神经元网络的可视化从概念上启发了我们开发 SFC 分析 在功能连接的框架内。 作为 SFC 分析的输入,我们首先通过计算预处理的 BOLD 图像中每个体素与每个其他体素时间过程的 Pearson R 相关性,计算每个参与者全脑网络的个体关联矩阵(见图 1 B)。 为了执行此分析,每个单独的 BOLD 图像之前都转换为 N×M 矩阵,其中 N 是 MNI 空间中的图像体素,M 是 124 个采集时间点。 使用覆盖整个大脑(皮层、皮层下、脑干和小脑)的 4652 个体素掩模来提取时间进程。 结果,获得了每个个体的 4652*4652 Pearson R 矩阵,或称乘积矩相关系数。 此后,仅考虑关联矩阵的正相关性。 接下来,我们应用 0.001 水平的 FDR(Benjamini 和 Hochberg)校正来控制最终网络邻接矩阵中的误报率。 该方法在每个个体中引入一个定制的高 r 阈值ÿ

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