circos 可视化手册-tile 篇

最新推荐文章于 2025-01-20 13:54:00 发布

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#circos

本文介绍了 circos 可视化中的 tile 特性，讲解了如何避免区域重叠并展示多个层次。内容涵盖位置相关属性（如 r0、r1、layer）和外观属性（如 thickness、color），并通过实例解析了 layer Overflow、margin 和 padding 的作用，以及如何使用条件控制区间的颜色和宽度。

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tile用来展示基因组上区域的分布，和之前介绍过的highlight不同的是，这些区域在图中并不是位于同一层的。为了避免不同区间之间的重叠，tile会将有重叠的区域分布在不同的层，结合图片来理解一下这个概念。示例图片如下
在这里插入图片描述
染色体之外的部分，就是tile了。可以看到，每个tile位于一个圆环区域内，其中的基本单位是一个个的矩形方块，我们称为tile; 不同的矩形方块不会有重叠，而是堆积成好几层。这里的每一层，我们称为layer。