肌肉X射线衍射成像自动化分析与SparkGIS:高效处理与评估
在生物研究和医学影像分析领域,X射线衍射成像技术以及组织图像分析算法的评估都具有重要意义。本文将介绍肌肉X射线衍射成像的自动化分析方法,以及用于组织图像分析算法评估的SparkGIS框架。
肌肉X射线衍射成像自动化分析
- 背景减除
- 首先,通过掩蔽包含峰对的弧线来减少衍射峰对背景的影响。具体操作是在每个峰对两侧各扫出12°的弧线进行掩蔽。
- 然后,对剩余图像的径向轮廓拟合双指数函数。计算图像围绕图案中心的径向轮廓,忽略衍射线条区域,拟合形式为
background = a + be−xc + de−xe的双指数函数。 - 最后,根据这些参数生成估计的背景图像,并从真实图像中减去,从而提取不受衍射背景干扰的d10峰作为感兴趣区域(ROI)。
- 使用MCMC过程进行图像建模
- 确定概率分布 :将背景减除并识别和分离出d10峰作为ROI后,应用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)采样来确定峰参数可能的概率分布。将峰视为来自皮尔逊VII分布,该分布常用于拟合X射线衍射峰。
- 初始峰拟合 :通过生成的峰与提取的ROI之间的残差最小化进行初始峰拟合,得到一组起始参数。
- MCMC采样准备 :选择平坦先验,因为对模型的
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