pytorch3d.ops.ball_query 用法

3D点云语义分割篇——PointNet++ PointNet++: Deep Hierarchical Feature Learning on Point Sets in a Metric Space Charles R. QiLi Yi Hao SuLeonidas J. Guibas Stanford University 上一篇文章介绍了PointNet以及相应的pytorch代码实现,在S3DIS数据集上完成了语义分割任务,这种直接处理无序点云的方式,和传统的基于人... 阅读详情

官网介绍:
在这里插入图片描述

输入是两个点云P1,P2(也可以是同一个,比如都是P1),

举个例子:

import torch
from pytorch3d.ops import ball_query

# 示例点云数据
N = 2  # 批次大小
P1 = 5  # 源点云中的点数
P2 = 3  # 查询点云中的点数
p1 = torch.rand(N, P1, 3)  # 形状为 (N, P1, 3) 的随机源点云
p2 = torch.rand(N, P2, 3)  # 形状为 (N, P2, 3) 的随机查询点云

# 球查询参数
radius = 0.5
K = 2

# 执行球查询
#要做的是以p1的点为中心,在p2中找邻居点,最大邻居可以找k个,不够K个的res.idx用-1填充
#res.dist用0填充
#返回res.idx是(N,P1,K)的shape
res = ball_query(p1, p2, radius=radius, K=K)

print("源点云 p1:", p1)
print("查询点云 p2:", p2)
print("邻居点索引 idx:", res.idx)

现在p1是(N,P1, 3)的3维点云,p2是(N, P2, 3)的3维点云。
现在以p1的点为中心,在p2里面找每个p1点的邻居,
邻居的上限限制在K,
找到的邻居不一定是距离最近的,但是是指定半径radius内的前K个。

如果找到的邻居数不够K个,那么res.dist里面会用0填充,res.idx会用-1填充。
返回res.idx的shape为(N,P1, K), 和p1的shape是一样的,也就是每个p1中的点找到的K个邻居。

引申:
看下面的代码

cutout_point_cloud = original_pcd[cutout_mask > 0]

for i in range(grow_iter):
    num_points_in_seed = seed_pcd.shape[0]
    res = pytorch3d.ops.ball_query(
        cutout_point_cloud.unsqueeze(0),
        seed_pcd.unsqueeze(0),
        K=1,
        radius=thresh,
        return_nn=False
    ).idx

    mask = (res != -1).sum(-1) != 0 #对最后一维求和,找到的邻居数量
    mask = mask.squeeze()
    seed_pcd = cutout_point_cloud[mask, :]

这段代码的初始pcd是cutout_point_cloud,要查询的pcd是seed_pcd(分割出的目标点云),
它要做的是以cutout_point_cloud的每个点为中心,在seed_pcd找K个邻居,
如果找到了邻居, 说明它不是孤立点,在分割目标附近,那么把这个点也加到分割目标里面,
迭代grow_iter次。
可以看作一个区域点的生长算法。

mmdetection3d环境配置过程error大全 1.undefined symbol: _ZN3c107Warning4warnENS_14SourceLocationERKSsb 应该是mmcv-full、pytorch、cuda这些版本不匹配原因 尝试过 torch1.3.1+mmcv-full1.3.1 × torch1.7.1+mmcv-full1.3.1 × 最后按recommend的 conda install pytorch1.5.0 cudatoolkit=10.1 torchvision0.6.0 -c pytorch 即torch1. 阅读详情

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B. Palm", title = "Prediction as a candidate for learning deep hierarchical models of data", year = "2012",}```Contact: rasmusbergpalm at gmail dot comDirectories included in the toolbox-----------------------------------`NN/` - A library for Feedforward Backpropagation Neural Networks`CNN/` - A library for Convolutional Neural Networks`DBN/` - A library for Deep Belief Networks`SAE/` - A library for Stacked Auto-Encoders`CAE/` - A library for Convolutional Auto-Encoders`util/` - Utility functions used by the libraries`data/` - Data used by the examples`tests/` - unit tests to verify toolbox is workingFor references on each library check REFS.mdSetup-----1. Download.2. addpath(genpath('DeepLearnToolbox'));Example: Deep Belief Network---------------------```matlabfunction test_example_DBNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit RBM and visualize its weightsrand('state',0)dbn.sizes = [100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);figure; visualize(dbn.rbm{1}.W'); % Visualize the RBM weights%% ex2 train a 100-100 hidden unit DBN and use its weights to initialize a NNrand('state',0)%train dbndbn.sizes = [100 100];opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;opts.momentum = 0;opts.alpha = 1;dbn = dbnsetup(dbn, train_x, opts);dbn = dbntrain(dbn, train_x, opts);%unfold dbn to nnnn = dbnunfoldtonn(dbn, 10);nn.activation_function = 'sigm';%train nnopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.10, 'Too big error');```Example: Stacked Auto-Encoders---------------------```matlabfunction test_example_SAEload mnist_uint8;train_x = double(train_x)/255;test_x = double(test_x)/255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);%% ex1 train a 100 hidden unit SDAE and use it to initialize a FFNN% Setup and train a stacked denoising autoencoder (SDAE)rand('state',0)sae = saesetup([784 100]);sae.ae{1}.activation_function = 'sigm';sae.ae{1}.learningRate = 1;sae.ae{1}.inputZeroMaskedFraction = 0.5;opts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;sae = saetrain(sae, train_x, opts);visualize(sae.ae{1}.W{1}(:,2:end)')% Use the SDAE to initialize a FFNNnn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm';nn.learningRate = 1;nn.W{1} = sae.ae{1}.W{1};% Train the FFNNopts.numepochs = 1;opts.batchsize = 100;nn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.16, 'Too big error');```Example: Convolutional Neural Nets---------------------```matlabfunction test_example_CNNload mnist_uint8;train_x = double(reshape(train_x',28,28,60000))/255;test_x = double(reshape(test_x',28,28,10000))/255;train_y = double(train_y');test_y = double(test_y');%% ex1 Train a 6c-2s-12c-2s Convolutional neural network %will run 1 epoch in about 200 second and get around 11% error. %With 100 epochs you'll get around 1.2% errorrand('state',0)cnn.layers = { struct('type', 'i') %input layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 6, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %sub sampling layer struct('type', 'c', 'outputmaps', 12, 'kernelsize', 5) %convolution layer struct('type', 's', 'scale', 2) %subsampling layer};cnn = cnnsetup(cnn, train_x, train_y);opts.alpha = 1;opts.batchsize = 50;opts.numepochs = 1;cnn = cnntrain(cnn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = cnntest(cnn, test_x, test_y);%plot mean squared errorfigure; plot(cnn.rL);assert(er<0.12, 'Too big error');```Example: Neural Networks---------------------```matlabfunction test_example_NNload mnist_uint8;train_x = double(train_x) / 255;test_x = double(test_x) / 255;train_y = double(train_y);test_y = double(test_y);% normalize[train_x, mu, sigma] = zscore(train_x);test_x = normalize(test_x, mu, sigma);%% ex1 vanilla neural netrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samples[nn, L] = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.08, 'Too big error');%% ex2 neural net with L2 weight decayrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.weightPenaltyL2 = 1e-4; % L2 weight decayopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex3 neural net with dropoutrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.dropoutFraction = 0.5; % Dropout fraction opts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex4 neural net with sigmoid activation functionrand('state',0)nn = nnsetup([784 100 10]);nn.activation_function = 'sigm'; % Sigmoid activation functionnn.learningRate = 1; % Sigm require a lower learning rateopts.numepochs = 1; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 100; % Take a mean gradient step over this many samplesnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex5 plotting functionalityrand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]);opts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through datann.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, train_x, train_y, opts);[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');%% ex6 neural net with sigmoid activation and plotting of validation and training error% split training data into training and validation datavx = train_x(1:10000,:);tx = train_x(10001:end,:);vy = train_y(1:10000,:);ty = train_y(10001:end,:);rand('state',0)nn = nnsetup([784 20 10]); nn.output = 'softmax'; % use softmax outputopts.numepochs = 5; % Number of full sweeps through dataopts.batchsize = 1000; % Take a mean gradient step over this many samplesopts.plot = 1; % enable plottingnn = nntrain(nn, tx, ty, opts, vx, vy); % nntrain takes validation set as last two arguments (optionally)[er, bad] = nntest(nn, test_x, test_y);assert(er < 0.1, 'Too big error');```[![Bitdeli Badge](https://d2weczhvl823v0.cloudfront.net/rasmusbergpalm/deeplearntoolbox/trend.png)](https://bitdeli.com/free "Bitdeli Badge")

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